基于metaBOOST的宏基因组范围内检测上位效应的关联研究

清华大学自动化系江瑞副教授等研究人员通过回顾上位效应的定义将其扩展到宏基因组学生物标记,综述了metaBOOST的方法并提供了详细信息。作者们描述了每个模拟研究以及真实宏基因组的数据,并且提供了结果。之后对真实数据集进行研究,并发布了结果。最终总结了作者们的方法,并讨论了未来可以改善的地方。该文章刊登在20147月的《BioMed Research International》杂志上。

参考文献:

Detecting Epistatic Interactions in Metagenome-Wide Association Studies by metaBOOST. Mengmeng Wu and Rui Jiang. BioMed Research International. 2014 Jul. 

作者简介:

江瑞:北京清华大学自动化系副教授。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第四课题组学术骨干。研究领域生物信息学、系统生物学、模式识别、机器学习、统计推断。