离子通道基因表达预测胶质瘤患者的存活率

离子通道在细胞增殖、迁移和凋亡中有重要的调节作用。离子通道的故障或异常表达都可能破坏这些重要的生物过程并且影响癌症的发展。苏州大学、东南大学和韩国中央大学等大学的研究员合作研究了离子通道基因在胶质瘤的表达模式。研究人员选定18个在高得分胶质瘤中差异表达的离子通道基因作为预后的分子标记。在这三个独立验证组中的离子通道表达基因是以标记预测胶质瘤结果为基础的。有趣的是,18个基因中有16个在高得分胶质瘤中是下调的。这个标记是独立于传统临床、分子和组织因素的。重新取样测试表明,该标记的预测能力优于所有验证组中来自人类基因组中的任意基因组。更重要的是,在三分之二的验证数据集中,该标记比从胶质瘤相关的基因中选择的任意基因标记都表现的好。这项研究暗示了脑癌中的离子通道,从而扩大了解他们在其它癌症中的角色。离子通道基因表达的个性化分析可以作为胶质瘤患者卓越独立的预测工具。该研究刊登在20158月的《Scientific Reports》杂志上。

参考文献:

Ion channel gene expression predicts survival in glioma patients.Rong Wanget al.Scientific Reports.2015 Aug.

作者简介:

顾万君:东南大学生物医学工程系,儿童发展与学习科学教育部重点实验室研究员。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第一课题组学术骨干。主要从事生物信息学,计算生物学方面研究。