5′非翻译区的RNA结构在microRNA介导的基因表达调控

最近的研究表明在人类基因序列中,5'非翻译区(5′ UTR)的信使RNAmRNA)的二级结构对microRNAmiRNA)介导的基因调控很重要。miRNA针对的mRNAs5‘端UTR(非编码区)容易有更高程度的局部二级结构。然而,miRNA介导基因的5UTR 表达调控的作用一般是未知的。东南大学生物医学工程系顾万君研究员团队,芝加哥伊利诺伊大学医学系周童研究员团队以及韩国中央大学医学院的研究人员合作,系统地调查了动植物的5UTR二级结构和发现一个普遍的趋势,动物中由miRNA调节的5’帽子附近的mRNA的稳定性增强,植物则没有。基因组内比较表明,基因的表达水平、5′端GC含量、miRNA靶位点的数目和5UTR的长度可能会影响5′帽子附近的mRNA结构。研究结果表明,在调节转录后的过程5UTR二级结构执行多种功能。虽然在启动密码子局部结构的上游涉及到翻译的开始、5′端帽子位点附近的RNA结构,而不是全长5UTR序列的结构,在miRNA介导的基因表达调控中起着重要的作用。该研究刊登在20158月《Bioinformatics》杂志上。

参考文献:

The role of RNA structure at 5’ untranslated region in microRNA-mediated gene regulation.Wanjun Gu, et al. Bioinformatics.2015 Aug.

作者简介:

顾万君:东南大学生物医学工程系,儿童发展与学习科学教育部重点实验室研究员。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第一课题组学术骨干。主要从事生物信息学,计算生物学方面研究。

周童:芝加哥伊利诺伊大学医学系的个性化呼吸医学研究所、肺科、急救护理科、睡眠和过敏科研究员。