核小体及染色质修饰的基因组分布模式和染色质状态

染色质是真核DNA 的存在方式,可以通过影响DNA 的可及性调节基因转录,其基本单元为核小体,系由约147 bpDNA缠绕在组蛋白八联体上形成的结构,核小体之间以连接DNA 相连核小体组蛋白上能发生甲基化和乙酰化等化学修饰核小体位置、DNA的甲基化和组蛋白的修饰等对染色质状态(常染色质或异染色质)及基因组之间的长程相互作用有重要影响近年,基于高通量测序技术,核小体位置和染色质修饰在多种细胞中的基因组分布已被测定结果显示,这些标记的分布模式具有位点特异、动态变化、相互偶联和高度复杂的特征本文详细回顾并评述了核小体位置和染色质修饰的分布模式、对应生物学功能、修饰之间的关联、实验测定技术、染色质状态的计算分析等内容该工作对于深入认识和理解染色质的表观遗传调节机制有重要意义该研究刊登在2013年第40期的《生物化学与生物物理进展》上。

参考文献:

核小体及染色质修饰的基因组分布模式和染色质状态刘宏德等,生物化学与生物物理进展.2013, 40.

作者简介:

孙啸:东南大学生物科学与医学工程学院教授,江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会主任。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第一课题组学术骨干。主要从事生物信息学研究。

刘宏德 :就职于东南大学生物科学与医学工程学院,主要从事生物信息学研究。

罗坤:副主任医师,新疆医科大学第一附属医院神经外科门诊,擅长颅底肿瘤,垂体瘤,颅咽管瘤及脑膜瘤的诊治。