人类基因组核小体组织序列的替换事件

东南大学生物科学与医学工程学院孙啸教授团队的研究表明,前体mRNA剪接发生共转录和核小体定位可能影响含有内在外显子序列。在真核基因组,大多数基因可能受到选择性剪接控制。在不同类型的替换事件序列核小体占据受人类全基因组核小体定位的数据集分析影响。被发现的核小体可优选定位在本构外显子或替换外显子的组成部分内,与基因表达或细胞状态不关联,但是与序列和剪接位点的序列保守性成正相关。此外,核小体在可替换受体外显子和可替换供体外显子中的分布不同。核小体自由区域中核小体占据周围的转录起始位点也显示出了强+1核小体富集与弱核小体占据。这些结果提供了新的方法更好地证明了染色质结构和基因表达调控之间的联系。该研究刊登在20125月的《BioSystems》杂志上。

参考文献:

Nucleosome organization in sequences of alternative events in human genome. Huan Huang,et al.BioSystems.2012 May.

作者简介:

孙啸:东南大学生物科学与医学工程学院教授,江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会主任。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第一课题组学术骨干。主要从事生物信息学研究。

刘宏德 :就职于东南大学生物科学与医学工程学院,主要从事生物信息学研究。