基因3'端附近核小体在人类基因组中的分布

根据人类基因组高通量测序数据集的系统分析,东南大学生物电子学国家重点实验室孙啸教授团队发现,蛋白质编码基因在相对非编码基因转录终止位点附近的特定染色质结构中, 有一个与之相关的多聚腺苷酸化。核小体无论在基因切割位点或聚腺苷酸化位点(polyA位点)的相对位置附近均被耗尽。DNA序列在核小体分布中起着重要作用,保守序列元件和蛋白结合是引起polyA位点附近的核小体枯竭的主要决定因素。此外,核小体枯竭是通过转录基因和RNA聚合酶IIRNAPII)位点调控的。研究结果表明,附近的聚腺苷酸化位点对核小体枯竭有影响,从而证实了核小体的分布调控蛋白质编码基因3'端的加工。该研究刊登在201310月的《Bioscience Biotechnology and Biochemistry 》杂志上。

参考文献:

Nucleosome distribution near the 3' ends of genes in the human genome..Huan Huang ,et al.Bioscience Biotechnology and Biochemistry .2013 Oct 

作者简介:

孙啸:东南大学生物科学与医学工程学院教授,江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会主任。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第一课题组学术骨干。主要从事生物信息学研究。

刘宏德 :就职于东南大学生物科学与医学工程学院,主要从事生物信息学研究。