人类疾病相关基因的表达敏感性分析

全基因组关联研究(GWAS)在寻求与复杂疾病的相关基因位点方面表明出其革命性的力量。成千上万的复制位点的共同特点对疾病的风险评估有所帮助。然而,仍难以阐明目前这些通过破坏蛋白质的表达或功能直接引起疾病易感性基因的变化。

上海生物信息技术研究中心 郝沛研究员合作中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所李轩研究员带领研究人员评估了疾病相关基因的表达的特点,并发现不同疾病相关基因在各种条件下显示不同的表达扰动敏感性。值得注意的是,一些与疾病有很强相关性的基因的表达没有在其对应的疾病发生显著变化,这些基因可能是表达谱分析中容易被忽视的。GO富集分析表明,与敏感的疾病基因相比较,与疾病强相关的基因实现相当重要的功能。跟强大的基因相关的疾病,似乎是比较致命的,如癌症和老化。另一方面,与敏感基因有关的疾病是显然不致命的,像迷幻和化学依赖性疾病。该研究发表在201311月的《Biomed Research International》杂志上。

参考文献:

Expression Sensitivity Analysis of Human Disease Related Genes. LiangXiao Ma, et al. Biomed Research International. 2013 Nov

作者简介:

郝沛:上海生物信息技术研究中心 研究员/课题组长。长期从事生物信息学研究和数据挖掘应用工具的研发。

李轩:中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所研究员,博士生导师。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第一课题组负责人。主要从事生物信息学和系统生物学的应用研究。