外显子测序揭秘Myo6移码突变造成听力损失

非综合征型常染色体显性遗传性耳聋(ADNSHL)是典型的语后发病。遗传异质性高,发病年龄晚,和各种混杂的非遗传因素阻碍了ADNSHL患者进行及时的分子诊断。中国人民解放军总医院耳鼻咽喉科主任医师袁慧军、清华大学教授张学工、张奇伟率领研究团队运用外显子测序技术对一个中国大家庭进行基因检测。研究人员首先对两个具有遗传病症的子家庭进行测序,通过测序样品在原本ADNSHL的遗传基因下又确定了两个新的突变。COCH(DFNA9)中的替换(c.328C>A)导致了p.Q110K的替换和MYO6 (DFNA22)的缺失(c. 2814_2815delAA) 造成了转码(p.R939Tfs2)。通过对家系中表型共分离分析及基因型表型的相关性的建立进行了仔细评估ADNSHL新型编码变异的致病基因。在Myo6移码缺失被确定为该家系的致病变种时,但认为COCH的错义突变没有临床意义。他们再次分析病人里导致了连锁扫描的错误的模拟数据。DFNA22新的基因型–表型相关性得到了临床数据的支持。该研究刊登在201411月《ANNALS OF HUMAN GENETICS》杂志上。

参考文献:

Exome Sequencing Identifies a Novel Frameshift Mutation of MYO6 as the Cause of Autosomal Dominant Nonsyndromic Hearing Loss in a Chinese Family.Jing Cheng,et al. ANNALS OF HUMAN GENETICS.2014 Nov

作者简介:

袁慧军:中国人民解放军总医院耳鼻咽喉科主任医师。主要研究:耳鼻喉科相关疾病。遗传性耳聋的分子机制、产前诊断及遗传咨询。

张学工:清华大学自动化系和信息国家实验室教授,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学部主任,生物信息学教育部重点实验室副主任。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》首席科学家,第四课题组负责人。主要科研领域方向机器学习与模式识别的理论、方法与应用。

张奇伟:清华大学信息学院与医学院双聘教授,清华信息国家实验室合成与系统生物实验室主任,首批千人计划教授。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》第三课题组负责人。主要科研领域与方向:计算生物学与生物信息学;合成生物与系统生物学。