RNAseqViewer:RNA-Seq数据可视化工具

随着RNA 测序技术的发展,科学家们急需一个分析转录组数据的新工具。清华大学自动化系和信息国家实验室张学工教授带领研究人员开发了一款专用于RNA-Seq数据分析的可视化软件:RNAseqViewer. 该软件可以展示单个样本或多个样本的转录组数据。是比较多个转录组分析的便利工具,例如比较基因组表达以及癌症样本的可变剪切或不同发育阶段等。RNAseqViewer免费获取地位为:http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/software/RNAseqViewer/。该研究刊登在2014年的《Bioinformatics》杂志上。

参考文献:

RNAseqViewer: visualization tool for RNA-Seq data. Xavier Roge´, et al. Bioinformatics. 2014

作者简介:

张学工:清华大学自动化系和信息国家实验室教授,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学部主任,生物信息学教育部重点实验室副主任。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》首席科学家,第四课题组负责人。主要科研领域方向机器学习与模式识别的理论、方法与应用。