二代测序技术结合传统舌诊方法判断舌苔微生物

舌诊是传统中医中独有的方法。清华大学自动化系和信息国家实验室张学工教授带领研究人员首次将传统舌诊结合基于二代测序的舌苔微生物鉴定进行研究。研究样本包含了经中医冷热综合症状诊断出的19名具有典型舌苔白腻或黄密的胃炎患者,以及8名健康志愿者。通过Illumina双端测序对舌苔微生物进行16S rRNA测序,每个样本获取3.7M V6标签reads。分析结果对冷/热症状的患者分别鉴定出123258个物种水平OTUs, 分别代表“冷症状微生物群”和“热症状微生物群”。然后根据冷热症状进一步构建了舌苔微生物不平衡网络。结果发现传统的舌诊和舌苔微生物有着重要关联,进一步表明舌苔微生物是病人分型的潜在的新的分子标记。该研究刊登在2012年的《Science reports》杂志上。

参考文献:

Integrating next-generation sequencingand traditional tongue diagnosis to determine tongue coating microbiome.Bai Jiang, et al. Science reports. 2012

作者简介:

张学工:清华大学自动化系和信息国家实验室教授,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学部主任,生物信息学教育部重点实验室副主任。清华973国家重点基础研究发展计划项目《基于新一代测序的生物信息学理论与方法》首席科学家,第四课题组负责人。主要科研领域方向机器学习与模式识别的理论、方法与应用。