翟巍巍

翟巍巍

中国科学院北京基因组研究所 副研究员 硕士生导师

 

简介

06/09-现在 副研究员,中国科学院北京基因组研究所,北京,中国

02/09-06/09 加州大学伯克利分校,整合生物系,博士后

09/04- 12/08 加州大学伯克利分校,整合生物系,博士

09/02-08/04 康奈尔大学,生物统计系,硕士

09/97-06/02 中国科学技术大学,生物系,本科

主要研究领域

1.群体遗传学(Population Genetics),我对种群遗传的里面的很多问题都有兴趣。例如,如何通过全基因组数据查找受过自然选择的区段,种群的演化历史的推断(Demographic History Inference),特别是人类迁移进化的历史,种群间/内多态性的分布(例如涉及代谢酶种内多态性的药物基因组学(Pharmacogenomics),个体化基因组学(Personalized Genomics) ),平衡选择(Balancing Selection) 作用下种群的动态性等等。

2.癌症/肿瘤基因组学(Cancer Genomics),和吴仲义,吕雪梅两位老师一起,我有幸接触到肿瘤遗传学里很多有趣的问题。例如肿瘤群体的进化演变的过程中,癌症致病突变(cancer causing mutation)在肿瘤群体进化过程中的作用, 个体发育(development)和衰老(ageing) 过程中体突变积累和发展过程, 癌症转移细胞群和原发癌群相互关系等等。

3.分子进化(Molecular Evolution),分子进化主要研究物种之间分化的过程,很多问题都很有意思。例如:gene tree/species tree concordance, 物种形成模式(Speciation mode), 以及如何通过物种间不同基因的比较(dN/dS),查找那些在物种间分化过程中受过正选择的基因片段等等。

4.疾病相关性研究(Disease Association study, 例如在全基因组疾病相关性(Genome Wide Association Study) 研究中如何做experimental design,基因组marker选择以及疾病基因和自然选择之间关系等等。

5.病毒和细菌类的进化(Viral and Microbial Evolution),我对很多病毒的进化都有很多兴趣,特别是感冒病毒(Influenza virus),HBVHuman Hepatitis Virus, HPV (Human Papillomavirus) 的进化模式,自然选择的作用和分布以及和pandemics/epidemics 之间的相互关系,host-parasite evolution等等。

另外,我对Statistical Genomics特别是machine learning一些手段在基因组数据下的一些应用,随机过程特别是continuous time Markov Chain 在分子进化中的应用和推广等问题有着很多兴趣。

代表论著

Weiwei Zhai, Melissa .J. Todd, Rasmus Nielsen Is Haplotype Block Identification Useful for Association Mapping Studies? Genet Epidemiol. 2004 Jul;27(1):80-3.

Weiwei Zhai, Montgomery Slatkin, Rasmus Nielsen Exploring Variation in the d ( N ) /d ( S ) Ratio Among Sites and Lineages Using Mutational Mappings: Applications to the Influenza Virus J Mol Evol. 2007 Sep;65(3):340-8

Zhai W, Nielsen R, Slatkin M. An investigation of the statistical power of neutrality tests based on comparative and population genetic data. Mol Biol Evol. 2009 Feb;26(2):273-83.