1、真正的小班授课,让每一位学员都执行出结果;
2、科学设计课程,循序渐进,课程包含Linux,测序原理,基因组分析,三代数据分析,重测序分析,外显子等,适合零基础开始;
3、以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能;
4、赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习;
5、赠送半年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可继续巩固学习,也可以分析自己数据;
6、培训结束之后,可继续微信群答疑交流。
王通:曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,上海,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过6000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程180多篇。
(根据现场情况适当调整进度)
日期 | 主题 | 课程安排 |
第1天
(上午) |
生物信息学简介及Linux操作 | 生物信息学简介
登录服务器 传输文件 常用Linux命令 选项参数 目录结构 权限管理 |
第1天
(下午) |
生物软件安装 | vim编写脚本
sh执行脚本 生物软件下载与安装 bioconda管理生物软件 PATH变量设置 |
第2天
(上午) |
生物数据下载 | 参考序列下载
数据库下载 SRA数据下载 批量下载数据 GTF文件下载 |
第2天
(下午) |
测序原理及数据质控 | 测序原理
一代测序 二代测序 三代测序 fastq文件格式 fastqc数据质控 数据过滤 进程管理 |
第3天
(上午) |
基因组拼接 | kmer估计基因组大小
基因组拼接原理 二代测序基因组拼接 基因组统计 QUAST评估组装质量 如何改善拼接效果 批量操作 |
第3天
(下午) |
三代测序数据处理 | nanopore数据质控过滤
Nanopolish进行组装错误校正 canu拼接nanopore数据 pacbio测序数据拼接 minimap2 比对参考序列 tablet可视化比对结果 |
第4天(上午) | 基因组分析 | 基因预测
ncRNA分析 重复序列分析 基因功能注释 基因家族分析 |
第4天
(下午) |
比较基因组分析 | nt库比对鉴定物种
nr库比对基因功能注释 多序列比对 构建系统发育树 利用iTol美化系统发育树 |
第5天
(上午) |
基因组变异检测 | 变异检测原理
bwa比对 bam文件格式 samtools工具处理sam/bam格式 |
第5天
(下午) |
基因组变异检测 | 利用freebays筛选SNP
bcftools工具处理vcf/bcf文件 利用IGV可视化比对结果 SNPeff注释工具 annovar工具 |
时间:2019年7月27 ~ 7月31日(五天)每天早上8:30~17:30
上课地址:北京市海淀区辰茂鸿翔酒店(地铁10号线牡丹园地铁站附近)
请自带电脑(windows与mac系统均可),提供午餐。
培训费用:4900元
付款方式:银行对公转账
单位名称:中科国测(北京)科技有限公司
开 户 行 :中国建设银行股份有限公司北京中南路支行
银行账号:11050163870000000021
可以现场刷卡或扫码支付等,会议通知等请联系工作人员。
1、零基础是否可以学会?
完全没有问题,我们本次培训班就是针对零基础学员,或者刚刚接触生物信息的学员,不要害怕自己是零基础,如果不学习,永远都是零基础。
2、上完课就能够自己做分析了吗?
可以,我们课上会演示大量操作案例,将脚本以及案例数据放到服务器上,只需要替换为自己数据即可完成分析。
3、赠送的服务器账号是做什么的?
生物信息分析需要大量的计算资源以及部署软件数据库,赠送的服务器在大家学习完成之后,可以使用该计算资源进行自己的数据分析,而无需继续购买计算资源和花费大量时间部署软件和数据库。
4、可以开发票吗?
可以,包括培训通知等,方便用户报销。
5、需要做哪些准备?
课程开始之前会发送在线视频和讲义,让用户预习Linux操作。
6、培训完后面有不会的问题怎么办?
生物信息学习是一样长期的任务,培训班结束了,学习并没有,我们有培训交流群,后续可以在群内继续交流学习。
本文由 SEQ.CN 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!