CoolMPS高通量测序试剂套装
华大智造首席科学家Rade Drmanac博士在AGBT上发表演讲
英国癌症研究所肿瘤分析团队(the Tumour Profiling Unit at the Institute of Cancer Research in the UK)的Nik Matthews博士,基于华大智造DNBSEQ-G400测序平台,分别利用StandardMPS和CoolMPS测序反应通用试剂套装,进行了WGS全基因组分析。
Q30提升
“这完全让我感到震惊。”Nik说,“当我第一次看到数据结果时,我才发现,原来仅将测序试剂的化学方法更换为CoolMPS版本,就可以进一步提高Q30、降低错误率,也就是说,通过‘几乎不做任何事情’,就获得了更多的数据,这太酷了。”
错误率进一步降低
加拿大卑诗省癌症研究所(BC Cancer Agency)迈克尔史密斯基因组科学中心(Genome Sciences Centre,GSC)副主任、生物信息学负责人Steven Jones博士在他的实验室利用DNBSEQ™平台展开了一系列针对肿瘤样本的研究工作,包括WGS,RNA和单细胞ATAC测序。通过对比分析基于华大智造DNBSEQ-G400和Illumina HiSeq的下机数据,Steven博士表示:数据表明肿瘤基因组分析结果在不同平台间“基本一致”。特别是基于华大智造DNBSEQ-G400的PCR-free方法获得的WGS数据,在15X的测序深度就可以达到传统的PCR WGS 30X的数据质量,重复读取的次数则更少、产生的有效数据更多,更具成本效益。
蒙特利尔麦吉尔大学(McGill University)的基因组学负责人Jiannis Ragoussis教授在AGBT发表了关于在DNBSEQ-G400上评估单细胞RNA测序性能表现的主题演讲,并将该数据与Illumina NovaSeq 6000进行了比较。
结果表明,MGI DNBSEQ-G400和Illumina NovaSeq 6000这两个平台之间的性能可比,数据相似,而MGI DNBSEQ-400实际上更加灵活且实用。“基于MGI平台,我们以可控的测序成本,获得了更多的reads数。我们不再囿于昂贵的试剂耗材而不得不混合多个文库。”
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