近日,华大基因推出BGI-PETA数据库系统,在提供专业精准的临床基因检测产品服务基础之上,为用户提供便捷的工具和优质服务。BGI-PETA是怎么样的数据库?可以协助解决哪些问题?跟随小编一起看看。
BGI-PETA(Pan-cancer Encyclopedia of Trans-omics Analysis)泛肿瘤跨组学百科全书,是华大肿瘤大数据服务系统,能帮助用户进行系统管理和分类繁琐海量的临床检测数据;简便快捷总结和分析数据,生成直观易懂的总结报告;在线与公开项目做数据对比分析,挖掘数据潜在科研价值;对复杂项目实现综合管理。它降低了复杂肿瘤组学数据的分析挖掘门槛,助力临床决策、新思路探索及科研产出。
图一 BGI-PETA系统服务架构
分析门槛低,点击即可完成大部分数据探索工作
无需生信技能,只要您有idea,结果立等可取,探索肿瘤大数据就是如此简便。BGI-PETA系统从专业繁琐的生物信息学分析工作中抽象出交互式可视化、亚组对比、单因素分析三大功能,通过鼠标点击即可实现。获得结果可包含您关注的患者详情,生存曲线,以及酷炫的Circos图。
图二 一键生成分析图
管理效率高,系统自动对接加强数据实时管理
海量数据池,链接整合多个公开项目数据
BGI-PETA系统在遵循数据使用规则前提下,尽可能全面链接主流公开项目,形成一套集成数据平台,为用户提供可供对比及挖掘的数据池。系统当前包含了30个原发部位的共81类(含亚型)肿瘤的组学数据,包含变异基因位点数据7,579,024条。
图三 数据库公开数据统计
图四 BGI-PETA系统V1.0 部分癌种数据分布
集社区之力,实现更多个性分析可能
图五 生信工具
贯穿数据全周期,构建肿瘤数据生态
图六 数据链完整
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