• 研究背景

过去几十年以来，随着测序技术的高速发展，如何从数据中挖掘具有生物意义的信息已经成为很多研究的关键，对基因的功能进行预测和注释是一个重要问题，如选择性剪切、选择性表达、假基因等。

目前，大多数基因功能注释都基于传统的短读长RNA测序数据，而该技术依赖于片段化以及对段片段DNA/RNA进行扩增，仅能覆盖部分转录本的长度，且往往会生成错误的组装。加州大学Ashley L. Byrne博士，基于纳米孔测序能够灵活识别全长转录本、各基因的多个同源异构体、量化问题异构体等优势，开发出Long-DASH工具——通过CRISPR/Cas9技术去除非模式生物中冗余的转录本，利用纳米孔长读长测序技术完成异构体水平的转录组分析。

· 去除全血和组织样本中冗余转录本的重要性

· Long-DASH工具——通过CRISPR/Cas9 去除冗余转录本，利用长读长测序完成异构体水平的转录组分析

· 利用Long-DASH，结合纳米孔长读长和其他短读长测序技术，完成北极熊全血样本全长cDNA测序和转录组异构体分析。

注：Nanopore技术目前仅供研究使用。