近年来,随着靶向及免疫治疗药物临床研究的不断开展和成功,各类癌症的临床治疗手段得到了突飞猛进的发展。基于各类分子标志物筛选靶向或免疫治疗的获益人群是肿瘤精准医疗的前提和基础,只有精准的诊断和检测才能实现临床的精准治疗。这也促使肿瘤的检测方法持续革新,以满足不断发展的癌症临床诊疗需求。当前,癌症分子病理检测方法已发展到高通量基因检测阶段,下一代测序(NGS)已被广泛应用于许多癌症中以指导治疗的选择。但另一方面,科学协会尚无关于将NGS用于肿瘤实践的指导性建议。此外,大型多基因测序panle的临床效用和成本效益仍因肿瘤类型以及靶向药物的疗效和可用性而异。
为了进一步规范二代测序的应用决策,欧洲肿瘤内科学会(ESMO)精准医学工作组日前邀请了多名行业知名专家对NGS在转移性癌症患者中的使用进行了全面、系统性的阐述,详细说明了如何在常规临床实践中开展NGS检测,并就各类转移性癌症患者的NGS检测做出了推荐建议。值得关注的是,除了总结NGS在各种类型癌症中的使用外,研究人员还探讨了涵盖范围更广泛的NGS是否应该取代用于检测单个基因或少数基因的小panel的话题。相关文章于8月24日发表在ESMO官方期刊 《肿瘤学年鉴》(Annals of Oncology),文章题为“Recommendations for the use of next-generation sequencing (NGS) for patients with metastatic cancers: a report from the ESMO Precision Medicine Working Group”。
文章第一作者、法国古斯塔夫鲁西研究所(IGR)Fernanda Mosele在一份声明中表示:“这是来自科学协学会关于NGS使用的首份推荐建议。我们的目的是以此统一将NGS用于转移性癌症患者的决策。”
为了达成这项共识,ESMO转化研究与精准医学工作组的成员利用“ESMO分子靶向临床可行性量表”(ESCAT),重点关注精准治疗的靶点与临床结局相关性。基于该量化系统及特定癌症患者中基因组改变的普遍程度,工作组评估了其证据等级和临床意义,并进一步评估了NGS的效率和临床价值,例如需要多少患者接受NGS检测才能识别出1例与有效药物相匹配的单个患者。除此之外,工作组还探讨了关于多基因测序使用的成本效益。
具体而言,ESMO从日常实践的建议、对临床研究中心的建议以及以患者为中心的建议三个层面,提出了应用NGS的推荐建议。根据当前证据,ESMO建议在晚期非鳞状非小细胞肺癌、前列腺癌、卵巢癌和胆管癌的肿瘤样本中常规使用NGS。在这些肿瘤中,如果大型多基因panel与小型panel相比增加了可接受的额外成本,则可以使用。在结肠癌中,NGS可以替代PCR。此外,ESMO建议在以下情况下检测肿瘤突变负荷(TMB):子宫颈癌、高度和中度分化的神经内分泌肿瘤、唾液腺癌、甲状腺癌和外阴癌以及未获得药物治疗的子宫内膜癌和小细胞肺癌(如果没有抗PD-1抗体)。除了这些肿瘤类型,证据还不足以证明NGS用作常规TMB检测的合理性。此外,作者不推荐多基因NGS用于转移性胃癌、胰腺癌或肝细胞癌患者。他们写道,对于这些类型的癌症,“价格低廉标准方法”可用于检测MSI或NTRK融合状态,但对于临床试验和药物开发则鼓励使用NGS。
除了多基因panel的适应症外,考虑到使用大型基因panel可能筛选出较少有临床意义的应答者,ESMO认为,在不增加公共卫生保健系统的额外费用以及告知患者受益的可能性较低的情况下,患者和医生可以共同决定是否订购大型panel。此外,ESMO还建议仅在国家或地区层面制定了获取计划和决策程序时,才可使用与基因组学相匹配的说明书外药物。最后,ESMO建议临床研究中心开发多基因测序作为筛选符合临床试验条件的患者和加快药物开发的工具,并前瞻性地采集数据以进一步指导优化该技术的使用。
Fernanda Mosele博士指出,使用NGS同时检测多个基因的优势之一在于只需要少量的组织样本,从而避免了多次活检的需要。“但是我们不能忘记,有时癌症会随着时间的推移而发生改变,因为它们会适应新的疗法。因此,我们必须在一开始检测很多变异的同时,也要意识到其中一些可能会随着时间而改变。”Fernanda Mosele总结道,“这篇论文强调了将精准医学方法从研究拓展到日常临床实践的挑战。例如,我们需要解决在特定人群中罕见癌症亚型或生物标志物更为常见但代表性不足的问题。ESMO致力于通过提供使用NGS的循证指南来弥合研究和实践之间的差距,从而使所有癌症患者都能平等地获得最佳的治疗机会。”
参考资料:
1. Mosele F, et al., (2020). Recommendations for the use of next-generation sequencing (NGS) for patients with metastatic cancers: A report from the ESMO Precision Medicine Working Group. Ann Oncol, DOI: https://doi.org/10.1016/j.annonc.2020.07.014
2. EUROPEAN SOCIETY FOR MEDICAL ONCOLOGY. ESMO issues first recommendations on using next-generation sequencing for advanced cancers
https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-08/esfm-eif082120.php
3. Genomeweb. ESMO Recommendations Outline Use of Next-Gen Sequencing in Metastatic Cancer Patients
https://www.genomeweb.com/cancer/esmo-recommendations-outline-use-next-gen-sequencing-metastatic-cancer-patients#.X0hmEXot1PY
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