Pooling是测序文库上机前的临门一脚。经过数小时乃至几天的实验,初始样品终于变成浓度、片段大小都符合质控指标的library嗷嗷待测。Pooling实验通常由两位操作者协作。根据表单信息将文库归一化到一定浓度,再将想要合并测序的文库混合,耗时耗力。
事实上Pooling完全可以不需要密集的吸液移液操作,不需要这么多时间和精力投入,甚至就不需要移液器和吸头。采用Echo声波移液系统,12分钟即可完成384个文库Pooling1,而手工完成归一化和Pooling需耗时长达3小时。
Echo通过聚焦声波能量转移低至2.5nL的样品,不需要吸头,无物理接触。每秒传输几百个液滴实现nL到uL级的液体传输。Echo可以微量化反应体系到几微升,甚至数百纳升,将样品从微孔板任意孔快速转移到目的板任意孔。在基因组学及合成生物学中,被应用到微量化NGS建库和快速Pooling文库、引物、寡聚核苷酸探针当中。
图:Echo一步法NGS文库Pooling。左:将需要Pooling的各文库信息写入输入文件;右:Pooling运行示意
图:采用Echo比较384个文库的200nL/文库等体积混样和等摩尔量混样。结果显示经Echo Pooling后文库获得更加均一的测序量。
图:采用Echo完成文库定量,微量化反应体系至2uL、4uL及8uL绘制校准曲线
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