恶性肿瘤是人类健康的重要威胁,给患者、家庭及社会带来了沉重的负担。随着肿瘤精准诊疗的理念和技术在临床中不断普及,越来越多的患者从中获益。当下肿瘤靶向治疗和免疫治疗迅速发展,对肿瘤分子分型、肿瘤动态监测的灵敏性和精准度提出了更高的要求。技术的突飞猛进和临床的真实需求,迫切呼唤着新一代肿瘤基因检测解决方案的诞生。
2020年9月23日,由和瑞基因举办的“瑞变,遇见新未来—大Panel赋能肿瘤精准诊疗之路”主题卫星会于CSCO 2020期间成功召开。上海交通大学附属胸科医院陆舜教授、陆军军医大学新桥医院朱波教授、南昌大学附属第二医院刘安文教授、北京大学第三医院曹宝山教授、江苏省肿瘤医院陈凌翔教授、苏州市立医院谭洁教授、四川大学华西医院王永生教授以及广东省人民医院杨衿记教授等嘉宾出席了本次卫星会,并就大Panel在肿瘤精准诊疗中的价值进行了分享。
图1.会议主席、上海交通大学附属胸科医院陆舜教授致辞。
免疫治疗针对许多瘤种展示出良好的治疗效果,然而总体有效率仍然只有20%左右,我们需要开展基于准确分子分型的精准免疫治疗以提升总体的临床获益。目前免疫治疗常用的靶点包括PD-L1表达水平、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)等。其中TMB水平在非小细胞肺癌、黑色素瘤等癌种的多项临床研究中均显示出与总生存期(OR)及无进展生存期(PFS)的显著相关性,但既往的检测方法依赖全外显子测序,检测成本和样本起始量要求都很高,阻碍了其在临床中的应用。那么,临床上更为常用的大Panel能否很好地满足TMB评估的要求?针对这一问题,陆军军医大学新桥医院朱波教授在《基于新生抗原的肺癌精准诊疗》报告中指出,和瑞基因654基因Panel探针可覆盖对应基因全外显子区域,检测区间超过3M,检测结果与WES的一致性高达0.99,能够精准地评估TMB;同时涵盖20个免疫治疗正负向基因,预测效能进一步提升(图2)。
图2. 和瑞基因654基因Panel准确预测TMB。
图3. a)10名患者定制化Panel的基线和后续ctDNA测序结果,蓝色代表ICP基因被检出,红色代表未检出 b)WES突变谱与ICP (红)、其他商用Panel(蓝)重叠的基因数。
图4. cSMART助力罕见突变检出,指导临床决策。
肿瘤融合基因的检测可以指导多种靶向用药,包括FDA及NMPA批准的药物(如克唑替尼、色瑞替尼等)和多个临床试验药物。目前常用的融合基因检测方法包括FISH、IHC、RT-qPCR、NGS等。除NGS外的几种方法在准确性、操作门槛、样本要求等方面存在一定缺点,NGS有望成为更加贴近临床需求的技术选择。上海交通大学附属胸科医院陆舜教授指出,国内外指南及相关研究明确表示,DNA、RNA双水平检测是目前融合基因检测的最优方案,能够很好克服DNA水平单独检测的灵敏度问题,降低检测假阴性,保证检测及用药的精准性。
图5. 和瑞基因专利算法SVscan相比开源软件大幅提升融合编译检出率。
在卫星会上,参会嘉宾围绕大Panel在靶向治疗和免疫治疗的应用展开了热烈的讨论。专家提出,大Panel能够全面地覆盖有临床价值的多种生物标志物,可以为诊疗决策提供多维度的信息,指导精准用药,分析肿瘤遗传风险,实现动态监测,还可以避免免疫治疗中疾病超进展(hyper-progressive disease, HPD)的发生,促进用药安全。另一方面,大Panel拓展了临床研究的方法和视角,推动了新的生物标志物的发现和验证。大Panel已经被纳入越来越多的国际指南和共识,未来几年在肿瘤基因检测领域的份额有望快速提升。
关于和瑞基因
和瑞基因作为贝瑞基因成员企业创立于2017年,是一家专注肿瘤全病程的基因检测公司,在“一切肿瘤实现早诊早治,所有患者获得精准治疗”的使命引领下,建立了针对肿瘤高危人群和患者的完整基因检测产品服务体系:包括肿瘤遗传易感性分析、早期筛查、靶向与免疫用药检测、疗效监测、预后判断等系列产品。在肿瘤早期筛查诊断领域,启动了包括肝癌、肺癌、妇科肿瘤等一系列早筛早诊临床研究项目;完成了两地(福州、北京)三中心(实验、超算、研发)的布局;致力于为临床肿瘤诊疗和个人健康管理提供更精准的肿瘤基因检测服务,合作和服务网络覆盖全国400多家三甲医院,已为数十万肿瘤患者提供了有价值的肿瘤基因检测服务。
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