疾病的发生、发展是一个复杂过程。基因变异、表观遗传的改变、基因表达水平、翻译后修饰、代谢结构异常等诸多因素,都会影响生命体特征的改变。近年来,单一组学研究瓶颈逐步显现,多组学渐成发展趋势。多组学联合研究从多分子层次出发,通过整合生物系统中基因组、转录组、蛋白质组、修饰组、代谢组、免疫组等细分方向,从多个维度呈现生物系统中立体的生物学过程。将这些丰富的信息关联起来,可极大地丰 富我们对疾病的认知,并将为创新药物研发带来巨大机遇。
在2021药物信息协会(DIA)中国年会上,由序祯达(SEQUANTA)联合因美纳(Illumina)和欧邻科(Olink)举办的午餐会现场,一场关于多组学技术如何助力药物研发的探讨成为热点。
打造多组学检测技术一站式平台
新药研发充满了挑战和不确定性,其中一个重要原因在于,过往所使用的孤立或单一的研究方法与思路,对复杂疾病(比如癌症)发生、发展机理的调查只是管中窥豹。多组学研究从基因组学、转录组学、表观遗传学、蛋白组学、免疫组学、代谢组学等方面着手,对复杂疾病获得更全面、更深入的了解。
序祯达致力于打造涵盖基因组、转录组、表观组、蛋白组等高质量多组学服务平台,将一流的技术与应用打通连接。为此,序祯达引进了因美纳的测序平台和TSO500肿瘤大panel、欧邻科的蛋白质组学检测技术,以及其他基于单细胞的多组学检测技术,合作推进精准医疗发展。
其中,因美纳的NGS服务是基因组学的基础,是多组学研究中的核心技术。作为全球目前最大的癌症基因信息数据库,TCGA项目主要依赖于大规模测序为主的基因组分析服务。
“TCGA项目的一个重大意义就在于,通过整合分析以基因组学为核心的多组学数据,实现了对常见癌症的更为精准的分子分型。”前休斯敦贝勒医学院人类基因组测序中心助理教授、现因美纳大中华区技术负责人汪敏博士介绍道,“近几年通过以NGS为基础的多组学研究让我们对癌症组织的免疫微环境也有了许多全新的认识。这些有价值的重要信息不仅加深了我们对癌症这种复杂疾病的理解,促进新药物靶点的发现,还帮助改进了药品临床试验入组人群的标准,提高了药物研发成功率。”
序祯达的另一位“好伙伴”欧邻科,以多重蛋白组检测技术见长。其蛋白组检测技术,也可以利用NGS测序仪产生数据,与获得的基因组数据联用,帮助科学家发掘新的药物靶点,有利于科学家更全面、精准地理解实时生物学。序祯达和欧邻科的合作,将共同推动先进蛋白质组学检测技术在中国的推广。
欧邻科中国区总经理韦利峰先生指出,“创新技术的采用,有一个过程。”同时他也表示,从欧邻科的经历看到,将多重蛋白组与基因组结合的多组学检测技术发展速度十分可观,“欧邻科2016年从瑞典出发进入北美市场,至今全球Top 20药企中有至少19家已经是欧邻科的客户。”
他相信,中国本土创新企业正不断谋求全球竞争力,越来越多的药物研发机构开始进行研发升级,从跟踪创新到源头创新。在与国际大药厂同场竞技的过程中,多组学检测技术必将成为一些卓越的头部企业重要的研究工具。
面对上述产业变革,序祯达携手因美纳、欧邻科等技术提供商,基于具备CLIA/CAP资质的高标准实验室,共同打造多组学一站式服务平台。
多组学技术的临床应用
事实上,多组学的临床应用此前已经开始,包括肿瘤、自身免疫病、感染性疾病等适应证上。首都医科大学张恒辉教授认为,得益于体液和组织等多元化的样本,加之资本市场的关注,肿瘤的多组学探索进展速度最快。
“在临床方面,特别是对疾病的认知,目前已经到了一个更高的维度,数据整合将会给我们提供更多的信息。”上海交通大学医学院附属瑞金医院研究员曹亚南教授如是作比,“不论是诊断、治疗还是相关的药物研发领域,低垂的果实已经被摘完了。我们怎样去发现新的靶点、诊断方法,必须回归到技术的进步。”
换句话说,当前的基础研究需要更大的样本量、更复杂的试验设计。从数据层面看,也需要更高的分辨率。分辨率的内涵是,我们得从过去的群体视角,切换到个体视角、基因组学视角、蛋白组学视角,再到如今的多组学视角的应用。
曹亚南教授补充道:“我觉得大家可以达成一种共识,通过这些数据和生产技术的突破,也许会给生物医药领域带来更多的机会。最终临床应用上,国内的研究,包括由此产生的数据,能够为本土患者提供更有针对性的帮助。”
这不仅是曹亚南教授的心愿,也是序祯达的愿景。序祯达研发中心负责人李源博士相信,一个专业的高质量的服务平台,能够更好地让多组学上下游的各个合作伙伴相互赋能。而这,也是助力打造精准医疗,尤其是创新药物研发良好生态的重要命题。
如何构建多组学的产业生态?
汪敏博士表示:“良好的生态环境涉及到很多方面,包括国家政策,还有投资人,都会对产业产生很大的影响和推动。如果用一个词来加以概括,我觉得是“顺势”。站在多组学的潮头和风口,扎实地做好科研基础工作,同时也积极地开拓应用领域,这样才能更好地把握产业的发展方向和机遇。”
不仅是企业,研究机构、临床机构、投资机构都需要置身其中。正如韦利峰先生所说的,自然界的不同生态是围绕太阳而发展起来,不论是药物研发,还是肿瘤早筛等其他应用场景,重要的是找到像自然界中的太阳一样的diver。
“对于我们来说,未被满足的临床需求,是一个持续的驱动力。我们愿意围绕这个初衷,服务于整个精准医疗的市场。”韦利峰先生进一步补充。
张恒辉教授从临床资源、资金、人才队伍支持的角度分享看法。“需要有稳定的实验室服务、生物信息分析人员、持续的经费支撑,才使得整个生态朝着可持续的方向发展。”
此外,在活动现场,序祯达和欧邻科达成了战略合作签约。双方将共同利用各自优势资源,持续推动多组学技术的落地与应用。
会议现场
其中最具特色的检测包括FoundationOne CDx、用于组织和ctDNA的Illumina TSO500检测、10x Genomics单细胞解决方案、Olink Target 96 qPCR、基于NovaSeq的Olink Explore 1536 Panel、宏基因组测序、mRNA测序、smRNA测序、全基因组测序、外显子组测序等,并可根据特定项目需求提供各种定制化Panel检测。
网站:https://www.sequanta.com/
邮件: info@sequanta.com
电话: +86 21 2050 0599
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