2021年10月29日~31日，第十六届国际基因组学大会（The 16th Annual Meeting of International Conference on Genomics，ICG-16）在山东青岛汉德博阁会议酒店隆重召开，真固生物受邀参加此次盛会。会议期间，真固研发总监王博博士围绕“真固生物首款FDA跨癌种NGS伴随诊断试剂盒&MGI平台应用”作专题报告。
真固生物依托美国公司Pillar Biosciences自主研发的专利多重PCR扩增建库技术——SLIMamp™，与华大智造合作研发三款肿瘤基因检测试剂盒：泛癌种59基因热点和CNV检测试剂盒、泛癌种cfDNA31基因热点检测Panel、肺癌RNA融合8基因检测试剂盒。研究团队将这三款试剂盒应用于MGI平台（MGISEQ-2000/MGISEQ-200），数据显示应用性能良好。同时利用MGISP-100自动化建库设备、真固生物自主研发的生信分析平台PiVAT®（The Pillar Variant Analysis Toolkit）以及华大的ZMART分析应用的集成，实现了从样本制备、测序到最终发布临床报告的全流程自动化一体解决方案。
1.泛癌种59基因热点和CNV检测试剂盒（华大平台）
——可检测59个基因的309个热点区域，可以检测SNV、indels和CNV，平均扩增子长度138bp，覆盖区域总长度25kb。
（3种标准品：肿瘤 SNV 1-25% gDNA 标准品、肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品、泛肿瘤 800 gDNA 标准品）
* QC指标为比对后bam文件的统计，非原始下机结果
针对15个目标突变（SNV/indels）以及ERBB2 CNV扩增，所有样本的检出率均为100%，检测突变频率与理论值偏差在1.5%以内，CNV偏差在0.45个拷贝以内。并且手工建库与SP-100自动建库的结果无统计学差异，5 ng、10 ng、20 ng起始量的结果之间也无统计学差异。
2.泛癌种cfDNA31基因热点检测Panel（华大平台）
——可对血液中游离DNA基因序列进行靶向多重PCR扩增，构建测序文库。该panel通过增加UIDs增加cfDNA检测的敏感性和特异性，实现31个实体瘤相关基因的SNV，indels变异检测。
利用3种标准品【ctDNA标准品套装（1%)、肺癌ctDNA标准品套装（0.1%)、肺癌ctDNA标准品套装（0%)】在两个独立实验室进行平行实验。
QC指标为比对后bam文件的统计，非原始下机结果
从以上数据可看出，自动化建库与手动建库的实验结果也无显著差异，自动化建库的个别指标更加稳定。针对1‰左右的低频突变的检测对实验要求较高、影响因素较多，需要更高的DNA起始量。从过往验证数据来看，在40ng起始量时，此panel针对0.5%和0.2%突变频率的变异检出率为100%，针对0.1%突变频率的变异检出率为93.75%。
——采用多重PCR技术进行融合mRNA的检测，检测覆盖8个融合频率较高的驱动基因，可用于肺癌分子分型和靶向药物用药指导，适用于FFPE样本和新鲜组织样本。
对比实验结果，SP-100自动化建库与手工建库没有显著差异，自动化建库结果更加稳定。在RNA融合检测中，利用自动化建库，可达到100%的检出率。
利用12例真实临床样本进行验证，与第三方独立实验室的临床报告进行比对（独立检测试剂），符合率100%，突变频率与CNV拷贝数都高度一致。
王博博士表示，随着肿瘤市场需求的日益递增，真固生物将携手华大智造，在提高基因检测的精准度与高效性的基础上，陆续推出更多高性价比的新产品，以满足日益增长的多元化NGS检测市场需求。
此外，王博博士就2021年7月Pillar已获美国食品药品监督管理局 (FDA）上市批准的肺癌结直肠癌基因检测试剂盒——oncoReveal™ Dx的数据成果进行了展示。该产品是一种基于组织的NGS跨癌种伴随诊断检测试剂盒，用于检测非小细胞肺癌 (NSCLC) 和结肠直肠癌 (CRC) 肿瘤DNA中的体细胞突变。这是同时获得FDA和CE双认证的第一款肿瘤NGS-IVD跨癌种伴随诊断试剂盒。此外，真固生物oncoReveal™ Dx试剂盒也预计在今年底或明年初获NMPA批准，预示该款试剂盒即将成为一款全球化认可的伴随诊断产品。
oncoReveal™ Dx试剂盒已经适配Illumina、MGI和Ion Torrent平台，其核心技术SLIMamp™主要具备三个特点：
1. 极速且操作简单，建库只需5小时，单管操作；
2. 需要的样本量极少，起始量低至2.5ng依然可以成功建库；
3. 低质量样本依然可以准确检出，即使是重度降解的样本。
我们也期待与行业专家及同道并肩前行，共同努力，不断进行技术革新和应用开发，促进个体化精准诊疗的普及应用，真正实现精准医疗大众化！
