2021年12月21日,百奥智汇推出全新版本单细胞大数据平台OmniBrowser™ v3.1。v3.1版本是该平台自2021年年初发布v3.0之后的重大更新,在用户界面、分析功能、数据检索等方面都有进一步的优化和提升,大大降低单细胞数据分析与挖掘的门槛,助力药物研发与科研探索。
OmniBrowser™ v3.1最新推出的跨数据集比对功能,可帮助用户更好地从全局的角度对单细胞数据进行比对,获得治疗前后、正常与疾病、不同疾病发展进程、不同癌症种类、不同癌症分型等多角度高精度的基因表达和细胞分群占比等差异。用t-SNE/UMAP图、Violin Plot、Bubble Plot等形式进行可视化展示,并支持查看选定数据集的Meta信息和Marker gene列表。
OmniBrowser™ v3.1支持用户根据现有数据集鉴定的细胞类型对TCGA/GTEx数据进行单细胞精度的挖掘,计算这些细胞类型在TCGA/GTEx内特定肿瘤、特定组织类型中的占比,或特定基因在特定肿瘤、特定组织的这些细胞中的表达情况。
OmniBrowser™ v3.1将单细胞研究的全部元数据纳入分析结果,支持用户根据治疗前后、用药前后、不同疾病阶段、不同细胞系、不同性别等对数据进行检索及多维度比较,获得更深度的见解。
OmniBrowser™ v3.1版本针对界面做了优化,从视觉到搜索功能方面都能保证用户有更好的体验。
自今年年初发布以来,OmniBrowser™中的数据集一直在不断更新,现已收录1,350+前沿单细胞研究,2,600+数据集,包含的细胞数超过4,200万,覆盖各个研究领域,包括疾病、肿瘤、发育、免疫、神经科学、细胞图谱等。其中,人的肿瘤相关数据集超过400个,为临床研究提供更多参考。
OmniBrowser™ v3.1目前已支持10x Visium平台、TCR信息的数据展示和分析,可以在平台上看到不同亚群的空间位置分布以及样本中TCR克隆型的信息,帮助用户获取多维数据信息,获得更深度的生物学见解。
1) OmniBrowser™赋能药物研发
2) OmniBrowser™赋能科研探索
目前,全新版本OmniBrowser™平台已开放试用,用户通过以下链接申请免费试用:
https://omnibrowser.abiosciences.com/#/user/register
新版本发布会将在2021年12月23日下午2点举行,将针对以上新功能及OmniBrowser™应用场景进行详细讲解,欢迎扫描下方二维码报名参与。
期待您的参与
百奥智汇是一家生命科学技术公司,致力于将单细胞机理研究平台和生物信息学大数据/AI平台充分应用于癌症等重大人类疾病的诊断和治疗。通过创建人类疾病的精准细胞图谱,充分利用自身强大的科研能力、自有平台和数据,百奥智汇将寻找具突破性的疾病诊断和治疗靶标、开发颠覆性的治疗方法。
欲了解更多关于百奥智汇的信息或服务,可通过下方的通讯方式进行联系。
官网:www.abiosciences.com.cn
电话:010-6256 6819
邮箱:bd_china@abiosciences.com
微信:baiaozhihui01
本文由 SEQ.CN 作者:白云 发表,转载请注明来源!