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NEJM子刊 | 可预测髓系恶性肿瘤的新预后模型CHRS,助力CHIP/CCUS患者的临床早期决策及研究

早期癌症检测的一个关键目标是识别具有最大进展风险的癌前状态个体。克隆性造血(CH)是指造血干细胞(HPSC)由于基因突变而引起的髓细胞增生,其通常由白血病驱动基因的体细胞突变引起。意义不明克隆性造血(CHIP)和克隆性血细胞减少症(CCUS)则由髓系肿瘤(MN)相关基因的体细胞突变引起,其变异等位基因分数(VAF)均≥0.02。数据显示,60岁以上患CHIP/CCUS个体的诊断率正在逐年增加,确定能够预测MN风险的因子将有助于医生进行临床管理和治疗。
少数CHIP/CCUS患者进展为MN的风险高达90%。对CHIP/CCUS患者进行风险分层可以帮助临床医生识别高危患者并对其进行早期干预,同时避免对低危患者的过度诊断、不必要的监测和治疗。已有研究报告了与MN演变相关的特征,包括某些高风险基因突变、特定共突变模式等,但目前尚未有针对CHIP/CCUS的系统性风险预测工具。

近期,美国丹娜-法伯癌症研究所、哈佛大学医学院以及意大利帕维亚大学等研究团队合作,对438,890名英国生物银行(UKB)参与者的遗传数据、实验室数值和MN结果数据进行分析,确定了能够预测MN事件风险的CHIP/CCUS特征。研究团队通过统计、整合加权特征进一步开发了CH风险评分模型CHRS,这是一种简单的预后模型,可用于区分普通人群和患者队列中的高风险和低风险CHIP/CCUS患者。相关结果发表在NEJM Evidence上,文章题为:“Prediction of Risk for Myeloid Malignancy in Clonal Hematopoiesis”。

文章发表在NEJM Evidence

MN患者的基因型特异性风险

研究团队共纳入438,890名符合研究条件的UKB参与者,分析了其中193,743人(推导队列)的全外显子组测序数据,最终确定了11,337名符合CHIP或CCUS标准的个体(图1)。与先前研究一致,研究发现,DNMT3A、TET2ASXL1是CHIP/CCUS中最常见的突变基因;与CHIP相比,CCUS患者的VAF更高、MN的累积发病率也更高

研究团队对每个基因进行Cox比例风险模型分析,并依据性别、癌症史和吸烟史进行调整。结果显示,SRSF5、SF2B3、ZRSR1、JAK2、RUNX2IDH1突变为高风险突变;剪接因子基因、AML-like基因突变与MN事件发生风险增加相关(9.26倍和13.8倍),可归为高风险基因。此外,虽未观察到TP53相关突变与MN事件之间的直接关联,但鉴于已有研究经验,研究团队依旧将其添加至最终高风险突变列表中。

图1. CHIP/CCUS参与者MN风险的特征。来源:NEJM Evidence

克隆性造血的风险评分

研究团队使用基于条件概率的RP分析来确定能够预测MN事件10年发生概率的关键因子,对CHIP/CCUS患者群体进行分析(图2)。结果显示,概率从0.0077到0.85不等,显示MN风险的显著差异性。

CHRS值被定义为每个预后变量的加权评分之和,多数CHIP/CCUS患者的CHRS值较低。研究团队定义了三个风险组:高风险(CHRS≥12.5)、中等风险(CHRS为10~12)和低风险(CHRS≤9.5)。相对于低风险CHIP/CCUS,中高风险CHIP/CCUS的MN事件发生风险分别高11.8倍和101.1倍。此外,高、中、低风险CHIP/CCUS组MN事件的10年累积发病率分别为52.2±4.96%、7.83±0.807%和0.669±0.0827%。

CHRS组显示出明显的生存差异。高风险CHIP/CCUS患者的10年生存率为51.2±4.51%,中高风险CHIP/CCUS患者为84.0±1.06%,低风险CHIP/CCUS患者为93.7±0.243%,没有CHIP/CCUS的个体则为95.8±0.0471%。与中低风险CHIP/CCUS相比,高风险CHIP/CCUS中CH相关合并症的风险更高,包括缺血性心血管疾病、动脉和静脉血栓栓塞性疾病、慢性肾脏疾病等。

图2. CHRS分布和风险分层。来源:NEJM Evidence

CHRS模型的验证

研究团队纳入245,147名UKB参与者组成验证队列,对CHRS模型进行验证。结果显示,CHRS的C指数为0.799±0.015,表明其在验证数据集和推导数据集中表现相同。接下来,研究团队将CHRS应用于两个独立的患者队列(DFCI/BWH CHIP/CCUS队列、Pavia CCUS队列),在临床环境中对其进行验证(图3)。在上述两个队列中,CHRS的C指数均超过0.7;与UKB队列相比,两个血液病患者队列具有更高的CHRS值。此外,在典型CHIP/CCUS 患者中,CHRS准确区分了疾病进展为MN的高风险及低风险个体。上述结果表明了CHRS在临床环境中的有效性

图3. CHRS在血液病患者队列中的验证。来源:NEJM Evidence

结 语

综上所述,该研究报告了预测CHIP/CCUS中MN事件所需的遗传特征,并将其纳入预测髓系恶性肿瘤的新预后模型CHRS。CHRS明确定义了三个不同的CHIP/CCUS风险组,并显示绝大多数CHIP和CCUS中进展为显性MN事件的绝对风险较低。CHRS为CHIP/CCUS患者的预后预测提供了一个直观框架,允许优先对最有可能进展为MN的少数CHIP/CCUS患者进行强化监测和治疗干预,有助于临床决策和研究。

参考资料:
Weeks, L. D., Niroula, A., Neuberg, D., Wong, W., et al. Prediction of risk for myeloid malignancy in clonal hematopoiesis. NEJM Evidence, 2(5), EVIDoa2200310.
https://evidence.nejm.org/doi/10.1056/EVIDoa2200310
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本文由 SEQ.CN 作者:白云 发表,转载请注明来源!

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