迄今最大空间组学研究计划MOSAIC启动！Owkin、NanoString等机构联合绘制癌症空间组学图谱
近日，人工智能精准医学公司Owkin、空间生物学公司NanoString Technologies联合美国匹兹堡大学、法国Gustave Roussy癌症研究中心、瑞士洛桑大学医院等世界领先的癌症研究机构组成了联盟，启动了5000万美元的空间组学研究计划，将空间组学技术用于高级癌症研究。
这一具有里程碑意义的计划名为癌症空间组学图谱（Multi Omic Spatial Atlas in Cancer，MOSAIC）。MOSAIC旨在收集数千名癌症患者的空间组学数据，使用空间组学技术进行分析，挖掘免疫肿瘤亚型，寻找新的生物标志物和治疗方法。该计划目标是追踪7种医疗需求未得到满足的癌症，包括非小细胞肺癌、三阴性乳腺癌、弥漫性大B细胞淋巴瘤、卵巢癌、胶质母细胞瘤、间皮瘤和膀胱癌，为每种癌症收集一千名患者的信息，共计7000名患者。
MOSAIC依靠的尖端空间组学技术包括Owkin基于人工智能的数据科学技术，NanoString的GeoMx数字空间全转录组/蛋白组分析平台和CosMx单细胞空间分子原位成像系统。具体运作流程为：在使用NanoString的空间组学技术，结合RNA-seq、蛋白质组学、组织学和其他医学数据对患者数据进行分析后，Owkin将开发一个数据平台，并利用其机器学习专业知识（包括深度神经网络）来发现新的癌症生物学和潜在的疗法。MOSAIC及其标准化的数据生成和分析方法将向全球生物医学界开放，进一步推动肿瘤学研究的进步。
值得一提的是，MOSAIC的规模大大超过了现有的空间组学研究。目前，大多数涉及相关数据模式的研究受到样本量的限制（通常少于50）。相比之下，MOSAIC将分析7000名患者的数据，使科学家能够以相对大100倍的数据集进行研究，更好地理解癌症中复杂的生物过程。
据介绍，MOSAIC是第一个利用空间组学技术的同类项目，将构建迄今世界最大的癌症空间组学图谱，有可能开辟肿瘤治疗研究的新领域。空间组学允许研究人员以接近单细胞分辨率检查肿瘤，同时揭示肿瘤和免疫细胞的位置和分子活性。空间组学可以“放大”肿瘤异质性、细胞间通讯和肿瘤-免疫系统相互作用，提供分子相互作用的详细图谱，使科学家能够破译肿瘤与其环境之间的关键关系。MOSAIC旨在通过生成和分析前所未有的大量空间组学数据，结合多模态患者数据和人工智能，为具有挑战性的癌症开发更有针对性和有效的治疗方法。
Owkin公司联合创始人兼首席执行官Thomas Clozel 表示：
“空间组学、多模态患者数据和人工智能的融合将推动肿瘤学研究的下一场革命，为患者开启下一波突破性治疗的浪潮。MOSAIC将帮助我们以及我们的合作伙伴在抗击癌症方面取得前所未有的突破。”
NanoString公司总裁兼首席执行官Brad Gray表示：
“这个项目有可能改变我们对癌症生物学的理解，并激发新的诊断和治疗方法的发展。这是一次前所未有的合作，汇集了NanoString强大的空间生物学平台，来自顶级癌症研究中心最高质量的临床注释癌症样本，以及Owkin非凡的人工智能技术和分析学。”
美国匹兹堡大学UPMC Hillman癌症中心主任Robert Ferris博士表示：
“匹兹堡大学很高兴成为MOSAIC联盟的一员，该联盟将利用UPMC Hillman癌症中心的空间组学专业知识来了解微环境中的癌细胞。我们热衷于与其他大学和行业伙伴合作，以发现检测、治疗和预防癌症的可行见解。”
法国Gustave Roussy癌症研究中心主任Fabrice André教授表示：
“通过结合最先进技术的MOSAIC，我们可以进入理解肿瘤细胞及其微环境的机制和相互作用的新层面。这个令人兴奋的项目将帮助我们为患者发现新的治疗方法。世界上很少有研究中心参与如此大规模的项目。”
瑞士洛桑大学医院创新和临床研究主任Mauro Oddo教授表示：
“MOSAIC项目引入了在推进癌症预测和治疗方面具有巨大潜力的尖端医疗保健技术。这也证明了领先的学术型医院和生物技术公司之间的科学伙伴关系如何有助于成功地将创新转化为改善的患者护理。因此，对于我们来说这是一个很好的机会，特别是通过其生物医学数据科学中心以及医学肿瘤学和病理学部门，成为MOSAIC项目的一部分。”
德国Uniklinikum Erlangen病理研究所所长Arndt Hartmann教授表示：
“使用空间组学对大量预后不良且对新疗法有高度医学需求的癌症患者队列进行综合表征，将提供关于肿瘤和肿瘤微环境的前所未有的见解。由大型癌症中心和强大的商业合作伙伴组成的联盟为患者发现新治疗方案提供了独特的机会。”
德国Charité综合癌症中心主任Ulrich Keilholz教授表示：
“MOSAIC研究对我们来说是一个里程碑式的项目，也是一个令人兴奋的机会，可以显著拓宽单细胞多组学认知，并在非常详细的水平上实现对多种癌症的理解。”
空间组学这一创新方法将催化前所未有的科学突破，并改变我们对疾病机制的基本理解；机器学习对于分析空间组学和多模态数据的分析过程是非常重要的。通过空间组学技术和人工智能的结合，MOSAIC使研究人员能够以接近单细胞的分辨率检测分析癌症肿瘤，了解肿瘤微环境的复杂性，为肿瘤内的结构、分子相互作用和细胞通路提供前所未有的见解。
参考资料：
1.Owkin powers a new era in oncology research with MOSAIC – an unprecedented $50 million spatial atlas of cancer cells
https://owkin.com/en/publications-and-news/press-releases/owkin-powers-a-new-era-in-oncology-research-with-mosaic-an-unprecedented-50-million-spatial-atlas-of-cancer-cells
2.A spatial atlas to enable discovery of novel treatments for cancer patients
https://www.mosaic-research.com/newsfeed/a-spatial-atlas-to-enable-discovery-of-novel-treatments-for-cancer-patients
本文由 SEQ.CN 作者：白云 发表，转载请注明来源！
