虽然现有的商业化平台具备高通量单细胞捕获能力和基因检测效率的提升,但在单细胞解离和捕获过程中,依然存在细胞杂质、碎片、细胞团以及游离RNA污染混入其中,给单细胞数据带来背景噪音的干扰,不同程度上影响到数据质量,甚至影响到结果的准确性和可靠性。
Well-Paired-Seq单细胞测序系统
Well-Paired-Seq单细胞测序系统
点击图片观看视频
Well-Paired-seq单细胞捕获核心原理
Well-Paired-Seq单细胞测序整体解决方案提供一站式基础数据分析、图形展示和数据探索生信软件和工具。通过DynamicEX软件进行数据拆分、mapping和各项指标统计分析,并且生成基因表达矩阵;后续的降维聚类和差异分析无缝衔接常用的第三方软件(Seurat/Monocle)并可进行个性化分析和数据挖掘。
软件下载链接和安装教程:
https://github.com/DynamicBiosystems/DynamicEX
Well-Paired-Seq单细胞数据可视化可以通过CellFocus软件实现交互式细胞分群结果展示、辅助人工注释、差异基因展示、基因和基因集评分的展示,并具备图片和表格导出功能,方便用户零代码基础也可以进行个性化数据探索和人工细胞注释。软件免安装,解压压缩包即可使用。
CellFocus使用页面展示
数据展示
上述细胞注释均为自动注释结果
总 结
Well-Paired-Seq单细胞测序解决方案是德运康瑞在微孔板技术基础上巧妙设计了双孔嵌套式芯片,实现了背景清洗和降噪功能,细胞分群效果更佳;我们提供自动化DECODER仪器、商品化试剂盒和生信分析工具,细胞捕获效率提高到60%,细胞捕获量达到1万+,在PBMC以及多种实体组织样本中均有优异领先的基因检出性能,目前已成功测试上百种样本类型,细胞捕获数量和基因检测技术性能稳定性优异,对于脆弱细胞类型如中性粒细胞捕获都有明显的捕获优势。
本文由 SEQ.CN 作者:白云 发表,转载请注明来源!