近日,来自美国马萨诸塞州总医院(MGH)、布莱根妇女医院(BWH)、麻省理工学院和哈佛大学Broad研究所的研究人员在顶级期刊The New England Journal of Medicine上发表了题为“High-Resolution and Noninvasive Fetal Exome Screening”的correspondence文章。研究人员开发了一种非侵入性高分辨率产前基因筛查方法,称为无创胎儿测序(non-invasive fetal sequencing,NIFS)。NIFS可以从孕妇血液的循环游离DNA(cfDNA)中筛查胎儿全外显子组(图1),检测胎儿DNA序列的所有基因突变,并区分潜在的致病性突变与遗传自母体的可能良性突变。研究人员通过分析51名孕妇的血液样本评估了NIFS方法,表明NIFS能够捕获遗传自母体的基因突变,以及母体中不存在的与产前诊断相关的De novo突变。
文章发表于NEJM
整体而言,研究人员共对51例妊娠进行了NIFS初步检测(图1),包括在MGH和BWH接受护理孕妇的所有三个孕期。NIFS筛查使用母体血液样本,而不需要对母亲或父亲再进行单独的基因检测。结果表明,无论检测到的胎儿DNA数量如何,NIFS对检测胎儿基因组而不是母体基因组中的单碱基DNA变化、Indel都非常敏感。
图1.高分辨率NIFS工作流程
研究人员招募了36名孕妇及其伴侣,纳入标准关键是NT值(颈部半透明测量值)至少为5mm,至少有一个在妊娠早期或中期发现的胎儿异常,或两者都有。通过对从母体血浆中提取的cfDNA进行超深外显子组测序,鉴定了以下胎儿致病性突变,研究人员认为这些突变在妊娠期具有临床相关性:四种单核苷酸变异(SNV)、一种Indel、两种常染色体三体性、一种性染色体非整倍体、两个大拷贝数变异和一种不平衡倒位。
Brand H, Whelan CW, Duyzend M, Lemanski J, Salani M, Hao SP, Wong I, Valkanas E, Cusick C, Genetti C, Dobson L, Studwell C, Gianforcaro K, Wilkins-Haug L, Guseh S, Currall B, Gray K, Talkowski ME. High-Resolution and Noninvasive Fetal Exome Screening. N Engl J Med. 2023 Nov 23;389(21):2014-2016. doi: 10.1056/NEJMc2216144. PMID: 37991862.
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