单细胞技术已经成为现代生命科学研究的一个关键工具。其中,单细胞转录组测序可以揭示细胞间的异质性,鉴定及发现新的细胞亚群,对于理解组织中不同细胞类型的功能至关重要,为解决临床问题提供了有力支持。
随着技术的迅速发展,通量不断提高,成本也不断降低,这使得越来越多优秀的单细胞测序平台涌现出来。作为国内最早引入单细胞技术进行研究与应用的机构,博奥晶典在单细胞组学技术研究领域始终坚持自主创新和推进成果转化,在测序和分析工具上取得了一系列突破。
近日,博奥晶典再次创新推出了自研的sCelluFlu-A平台,这是一款行业领先、性能稳定、灵巧高效的液滴微流控高通量单细胞转录组解决方案,针对精准医学科研而设计,可为肿瘤研究、免疫研究、神经科学、发育生物学、药物开发、分子诊断等领域提供高效、高质量和高精度的研究数据,加速了单细胞转录组平台的国产化进程。
据了解,sCelluFlu-A平台具有高速度、高通量、高质量、高价值的优势。该平台仪器小巧轻便、操作简单,方便快速上门实验。基于创新的快速油包水液滴技术,sCelluFlu-A平台搭配国产测序平台和博奥自主研发的CellScope单细胞分析云平台,可快速完成组织到单细胞分析的所有工作,特别适合临床样本快速实验。值得关注的是,sCelluFlu-A平台的工作流程实现了全国产化,高效的平台设计使其能够快速、低成本地完成大规模单细胞转录组测序。
sCelluFlu-A平台最首要的特点是极速液滴,通过微流控分选仪可在150秒内快速形成包含探针胶珠和单个细胞的油包水液滴。这一创新技术大大缩短了细胞在实验中的暴露时间,可有效减少细胞的应激反应,从而最大程度地保留了细胞的原始状态,为后续实验数据的稳定性和准确性提供了有力保障。
sCelluFlu-A平台的高通量优势源于其采用的独立单芯片设计。该设计支持更加便捷的1-8个样本(最高支持20000个细胞/通道)灵活上样,用户可根据需求灵活调整,避免了传统芯片一体化设计中可能出现的浪费现象,实现了更加经济高效的使用方式;相比传统平台,sCelluFlu-A最大细胞量增加了一倍,充分实现了资源的最大化利用,有助于提供更为详尽和全面的单细胞转录组数据。此外,该平台的多胞率仅为<3%(10000细胞),细胞分选更是实现了零失败,这使其能够提供更加准确、稳定的高质量单细胞转录组数据。
值得一提的是,sCelluFlu-A的研发过程也堪称快速。据悉,该平台于2023年2月开始研发,仅耗时一年半即获得关键技术“单细胞微液滴生成芯片”的专利,并于2024年9月完成了一系列人/小鼠不同组织类型细胞或细胞核样本的实测。
资料显示,sCelluFlu-A平台的实测数据呈现高质量的优势特点,包括高捕获稳定性、高可重复性等,能够最大程度地保障每一个珍贵样本,尤其是临床样本的真实数据稳定可靠地获取。
表:sCelluFlu-A实测数据展示
稳定的细胞数和基因数:平均捕获细胞数10000以上,实际捕获细胞数与预期捕获细胞数比例在50%-150%之间;常规样本类型基因数中值稳定在1000-3000之间。
稳定捕获脆弱细胞或低丰度细胞类型:在人源骨髓样本中捕获脆弱的功能细胞有核红细胞(细胞占比35%)和不同发育阶段的中性粒细胞(细胞占比>30%);在肺组织中可捕获低丰度表达的内皮细胞、上皮细胞、纤毛细胞。
稳定的低线粒体和背景噪音占比:实测数据显示,不同样本类型中捕获线粒体比例较低(4%以下),常规PMBC样本中捕获线粒体比例可低至0.5%-1%,显著低于传统技术,极大地减少了测序数据中的背景噪音。
可重复性高:不同批次实验捕获得的细胞类型和细胞数量高度一致。例如,对人类外周血单个核细胞(PBMC)样本进行2次独立测试,结果显示细胞分群和细胞亚群的比例高度相似,表明sCelluFlu-A平台具有良好的重复性,为实验数据提供了可靠保障。
图:人PBMC样本2次独立实验的细胞分群和亚群占比统计
单细胞转录组技术在肿瘤、发育生物学等众多领域已取得了丰硕的研究成果。此外,单细胞转录组的应用也逐渐扩展到队列研究,成为规避研究中个体差异影响的有效技术手段。
凭借超高性价比这一优势,sCelluFlu-A平台精准定位两大应用方向:“老、弱、病、残”和大队列研究。“老、弱、病、残”分别指肿瘤、免疫、慢性病、发育研究,sCelluFlu-A将在这四个领域的研究中进行精准应用,提供高质量的单细胞转录组数据支持;sCelluFlu-A在大队列研究中的应用有助于大幅降低研究成本,例如肿瘤治疗队列、泛癌队列、神经退行性疾病队列、免疫疾病队列研究等,开启了国产单细胞平台的队列研究时代。同时,该平台在感染疾病、妇幼健康、药物筛选等领域也将有广阔的应用前景。
此外,博奥晶典利用医学合作共建的强大优势,将sCelluFlu-A平台纳入到精准医学诊断和科研的全国产方案中,将为临床研究市场贡献更多力量。
为促进“产学研”三位一体更好地结合,共同促进精准医学的发展,博奥晶典还发布了产学共建、三位一体的系统生物医学、科研和转化支持计划——SMRT Plan(Systematic bio-Medicine Research & Translation Plan)。
据悉,SMRT计划依托生物芯片北京国家工程研究中心技术优势,从系统科研服务、硬核产学共建和高效临床转化三个方面布局,旨在通过提供强大的科研支持及转化平台的多方向应用,为广大医学团队尤其是临床科研人员提供全方位科研解决方案。
系统的科研服务支持,博奥晶典可提供系统的科研服务、硬件以及软性支持。自2003年开展科研服务以来,博奥晶典已积累了20余年的科研服务经验。从高通量基因芯片到单细胞测序,博奥晶典一直走在科技研发的前沿,能够利用国家级的系统科研平台(包括样本前处理平台、测序芯片、质谱、影像平台等)提供全方位的科研服务、硬件和软性支持。
强大的产学共建支持,博奥晶典拥有全面的系统临床检验产品,结合转化的所有(报证)医学和科研产品,将共同纳入到SMRT计划中,从而实现产学研一体化闭环的全支撑的完整计划。
高效的临床转化平台支持,博奥晶典目前拥有6大转化平台(微流控平台、全自动芯片实验室平台、二代测序平台、PCR多联检平台、数字PCR平台、单分子免疫平台)可以应用于科研到临床的实际转化,涵盖了核酸、蛋白质等不同组学层面的实践应用,后续可通过LDT或者申报注册证的方式走向临床。
结语
随着单细胞技术的不断迭代,单细胞测序市场也经历着前所未有的变革,甚至可能打开全新的应用市场,以解决以往未被满足的需求。而随着市场竞争的不断加剧,国内外优秀的单细胞测序企业愈来愈重视对自研技术的创新开发,以及对当前市场环境和客户需求趋势变化的深入研究,以期提前占领市场,取得先发优势。因此,国内的单细胞测序公司面临着难得的发展机遇。
近年来,得益于国产替代的大趋势以及强劲的技术研发能力,博奥晶典正逐步向单细胞测序市场的上游发展。自2015年开展单细胞组学技术研究以来,博奥晶典在过去的9年中支持发表了300多篇单细胞空间组学文章,依托生物芯片北京国家工程研究中心强大的研发能力,在技术平台的国产化方面取得了实质性的进展与积极成效。目前,博奥晶典可提供单细胞空间测序、基因组学、表观组学、转录组学、代谢组学、微生物组学蛋白组学等30余种测序产品和服务。
此次发布的sCelluFlu-A平台,让国内的科研工作者们对国产单细胞平台有了更强的信心和期望。sCelluFlu-A平台性能稳定高效,全国产化的工作流程摆脱了对进口平台的过度依赖,降低成本的同时,能够帮助稳定获取可靠、精准、高质量的单细胞转录组数据,将肿瘤、免疫、慢性病、发育等各领域研究提供重要助力。同时,联合最新发布的SMRT计划,博奥晶典将通过提供专业、科学、严谨的精准医学产品和解决方案,持续推动单细胞领域的科研进步和临床转化,进而促进精准医学的发展。
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