在近日发表的《新英格兰医学杂志》上，香港中文大学的研究人员发布了关于鼻咽癌早期筛查的新研究成果。他们提出对血浆中游离EB病毒DNA进行检测的新思路，对超过20000名志愿者进行筛查取得了良好的效果！
在这次的研究中，研究人员筛查到的早期患者占全部的71%，而2013年香港地区全部患者中，发现的早期患者仅有20%，新方法在早期筛查方面远优于传统方法！
大家是不是觉得鼻咽癌离自己很远？它可远远没有肺癌、乳腺癌等癌症“出名”。然而事实上，至少80%的鼻咽癌病例都发生在中国等东南亚国家[2]，我国南方的发病率高于北方，特别是广东省，发病率可达30/10万，因此鼻咽癌还被称为“广东癌”，另外，中年男性也是最高发人群之一[3]。
由于鼻咽癌生长部位隐蔽，且缺乏特异性症状，所以早期诊断并不容易。中山大学肿瘤防治中心和香港癌症资料统计中心的数据显示，80%的鼻咽癌患者就诊时已出现肿瘤局部进展或远处转移[4]。
虽然鼻咽癌属于治疗效果较好的癌症，但是患者的预后与临床分期密切相关，I期患者的5年生存率可高达90%以上，而IV期患者的5年生存率则仅有50%左右[5]。所以说，即使是“好治”的癌症，也要早发现、早治疗，才能获得更好的治疗效果和更高的生存率。
新研究的通讯作者为卢煜明教授和陈君赐教授。卢煜明教授大家可能更为熟悉一些，他是美国国家科学院的外籍院士，被誉为“无创产前检测之父”。他和陈君赐教授都曾参与过2003年抗击SARS的研究，在研究小组成立后的第13天就破解了病毒的基因组序列并向全世界公布[6]。
卢煜明教授（右一）和陈君赐教授（右二）
在这次新的研究中，他们招募了20174名40-62岁的中国男性进行了实验（NCT02063399）。尽管目前鼻咽癌的发病机制仍然不是十分清楚，但是EB病毒（Epstein-Barr virus）的感染和饮食习惯是公认的外在影响因素。EB病毒作为最早被识别的人类肿瘤病毒，可以裂解，将自己的基因整合到人的细胞基因组中，诱导癌症的发生。
志愿者筛选和癌症筛查流程
由于EB病毒的相关标志物在鼻咽癌患者和非鼻咽癌患者中有显著差异，所以将它们作为鼻咽癌的诊断标志物一直是研究人员努力的方向。例如以EB病毒衣壳蛋白抗原的IgA抗体为标志物来进行EB病毒检测，这种方法的灵敏性虽然能够达到80%，但是特异性却很低，只有50%[7]，而新方法检测EB病毒游离DNA，可使特异性和敏感性分别提升至97.1%和98.6%。
那么新方法的突破在哪里呢？研究人员这次选用的标志物是血浆中的游离EB病毒DNA，而不再是蛋白。在早期癌症患者的血液中，游离的DNA只有非常小的一部分来自肿瘤，这就会影响使用它来监测癌症的灵敏性。而EB病毒也并非是在鼻咽癌患者中特异性存在，因此会出现假阳性的情况，所以如何提高检测的特异性，同样是很大的一个挑战。
在之前的研究中，他们发现鼻咽癌患者的EB病毒检测会一直呈阳性，而非鼻咽癌人群则不会[8]。因此，为了将假阳性率降到最低，他们会在初次检测呈阳性后的4周再进行第二次检测，若结果仍为阳性，则建议进行鼻咽镜和MRI两项检查以进一步明确诊断。在新的研究中，研究人员通过荧光实时定量PCR的方法来分析志愿者血样中的EB病毒DNA水平。
受试者中，共有309人检测结果为连续两次阳性，其中300人接受了鼻咽镜和MRI检查二者之一，有34人被确诊为鼻咽癌，其中I期和II期患者占比71%，以较为高发的香港鼻咽癌患者整体为对比，这一诊断发现的早期患者的比例远高于他们。研究人员对确诊患者进行的中位随访时间为24个月，随访显示，这批患者经治疗后的3年无进展生存率也比整体患者高出27%，而且只有一位患者出现复发。
新研究（左）和2013年香港地区所有鼻咽癌患者（右）I-IV期比例对比
统计结果显示，检测游离EB病毒DNA对鼻咽癌的阳性预测率为11%，虽然这一数值表面看来不是很高，但仍远超大多数肿瘤标记物平均3%的阳性预测率[9]，且筛查出的患者中I期患者比例高达47%！
对比2006-2010年中山大学肿瘤防治中心收治的2671名确诊的鼻咽癌患者，他们中有120名处于I期，仅占总患者数的4.5%[4]，也可印证新型检测手段早期筛查能力的优秀和出现的必要性。而在花费方面，研究人员表示，进行单次血清EB病毒DNA检测的费用为30美元，算上连续阳性的受试者需进行后续检查以确诊的费用，每位受试者的平均支出也只为48美元，这对早期防癌来说是完全可以接受的。
那么这一手段有望推广到其他癌症的早期筛查吗？研究人员认为是有可能的。不过利用这一思路检测与病毒感染无关的癌症类型，还需要选择更加有效的DNA标志物。
在同期刊登的社论中[10]，约翰霍普金斯大学血液肿瘤专家Richard F. Ambinder博士表示，早期鼻咽癌通常可以通过局部放疗治愈，而这次研究中检测到的鼻咽癌患者有将近一半都是处于I期，所以这项研究提供的方法是非常具有临床意义的。通过这次筛查，至少这些患者的生活已经得到了“挽救”。
他认为，在正确的使用背景下，血浆中EB病毒DNA的筛查是检测早期鼻咽癌的一个非常有前途的方法，就像宫颈细胞学检查或是宫颈癌早期筛查中的HPV检查一样，EB病毒DNA的筛查会深刻地改变鼻咽癌在人类中发展的“历史轨迹”。
参考资料：
[1] http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1701717?query=featured_home#iid=f02
[2] Lo K W, To K F, Huang D P. Focus on nasopharyngeal carcinoma[J]. Cancer cell, 2004, 5(5): 423-428.
[3] Tang L L, Chen W Q, Xue W Q, et al. Globaltrends in incidence and mortality of nasopharyngeal carcinoma[J]. Cancerletters, 2016, 374(1): 22-30.
[4] Li J, Zou X, Wu Y L, et al. A comparison between thesixth and seventh editions of the UICC/AJCC staging system for nasopharyngealcarcinoma in a Chinese cohort[J]. PloS one, 2014, 9(12): e116261.
[5] Lee A W M, Sze W M, Au J S K, et al. Treatmentresults for nasopharyngeal carcinoma in the modern era: the Hong Kongexperience[J]. International Journal of Radiation Oncology* Biology* Physics,2005, 61(4): 1107-1116
[6] https://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%9B%A7%E7%85%9C%E6%98%8E
[7] Coghill A E, Hsu W L, Pfeiffer R M, et al. Epstein–Barr Virus Serology as a Potential Screening Marker for Nasopharyngeal Carcinoma among High-Risk Individuals from Multiplex Families in Taiwan[J]. Cancer Epidemiology and Prevention Biomarkers, 2014, 23(7): 1213-1219.
[8] Chan KC, Hung EC, Woo JK, et al. Early detection of nasopharyngeal carcinoma by plasma Epstein-Barr virus DNA analysis in a surveillance program. Cancer 2013;119:1838-44.
[9] Wang H Y, Hsieh C H, Wen C N, et al. Cancersscreening in an asymptomatic population by using multiple tumour markers[J].PloS one, 2016, 11(6): e0158285
[10] http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMe1706815
来源：奇点网
2. 在8月8日在线发表于PNAS期刊的一篇文章中，来自犹他大学的科学家们表示，通过操纵一个名为“Arc”的基因的过表达，已成功恢复了小鼠大脑的可塑性，特别是成功重新激活了视觉皮质层的反应能力，这或许可以成为恢复大脑年轻潜力的新疗法！
3. 近日，美国国立卫生研究院的科学家利用CRISPR-Cas系统，开发了一种基因组规模的筛选手段，使研究人员能够敲除黑色素瘤细胞系中的每一个基因，然后系统地测试每个基因针对黑色素瘤的T细胞的应答反应。通过这种“双细胞类型-CRISPR”检测方法，研究人员确定了100多个影响免疫疗法的“必需”基因，使T细胞能够有效地识别并杀死肿瘤细胞。当这些基因被敲除时，肿瘤细胞更能抵抗识别相关抗原的T细胞。
4. 近日，澳大利亚联邦科学和工业研究组织日前宣布，该组织科学家领衔完成了对棉铃虫和谷实夜蛾这两种害虫的基因组测序，这一成果可能为全球农业防病害节省数以亿计的成本。由这个组织领衔、美德法等多国科学家参与的这项研究成功地辨识出棉铃虫和谷实夜蛾基因组的1.7万多个能够编码蛋白质的基因。
5. 日前，在一项新的研究中，来自美国亚利桑那州立大学、哈佛大学、麻省理工学院和布罗德研究所的研究人员证实了活细胞能够经诱导以一种微型机器人或计算机的形式执行计算。这项研究的结果对智能药物设计、智能药物运送、绿色能量产生和低成本诊断技术，甚至在未来开发能够捕获癌细胞或关闭异常基因的纳米机器，产生重要的影响。
6. 8月4日，中国科学家在英国《自然》杂志子刊《细胞研究》上发表的最新研究中表示，他们发现一个关键基因能调控水稻 “理想株型” 并有潜力增加其产量，这将有助未来培育出更高产量的水稻品种。研究团队成功分离并克隆了一个关键基因 NPT1。NPT1 能够调控水稻理想株型并有潜力增加其产量，将这一个基因和其他等位基因 DEP1 聚合导入中国现有高产水稻品种后，在现有产量基础上还能进一步提高水稻的产量。
【动物】
1. Identification of differentially expressed genes through RNA sequencing in goats (Capra hircus) at different postnatal stages.Lin Y et al.PLoS One. 2017 Aug 11
2. A transcriptome atlas of rabbit revealed by PacBio single-molecule long-read sequencing.Chen SY et al.Sci Rep. 2017 Aug 9.
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1. Toward Genomics-Based Breeding in C3 Cool-Season Perennial Grasses.Talukder SK et al.Front Plant Sci. 2017 Jul 26
【微生物】
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2. Insight Into the Origin and Evolution of the Vibrio parahaemolyticus Pandemic Strain.Espejo RT et al.Front Microbiol. 2017 Jul 24
3. Bacteria Associated to Plants Naturally Selected in a Historical PCB Polluted Soil Show Potential to Sustain Natural Attenuation.Vergani L et al. Front Microbiol. 2017 Jul 25
4. RNA Sequencing Reveals that Endoplasmic Reticulum Stress and Disruption of Membrane Integrity Underlie Dimethyl Trisulfide Toxicity against Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4.Zuo C et al. Front Microbiol. 2017 Jul 24
【肿瘤】
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3. Nanogrid single-nucleus RNA sequencing reveals phenotypic diversity in breast cancer.Gao R et al.Nat Commun. 2017 Aug 9
4. Replication stress leading to apoptosis within the S-phase contributes to synergism between vorinostat and AZD1775 in HNSCC harboring high risk TP53 mutation.Tanaka N et al.Clin Cancer Res. 2017 Aug 8
5. Differential expression profile analysis of DNA damage repair genes in CD133+/CD133- colorectal cancer cells.Lu Y et al.Oncol Lett. 2017 Aug
6. Integrated analysis of differential expression and alternative splicing of non-small cell lung cancer based on RNA sequencing.Li Z et al.Oncol Lett. 2017 Aug
【其他】
1. MinION Analysis and Reference Consortium: Phase 2 data release and analysis of R9.0 chemistry.Jain M et al.F1000Res. 2017 May 31
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