对于从事医学和生命科学研究的医生和科研工作者来说，罗氏也许并不仅仅是一家公司，同时也是一个熟悉而亲切的合作伙伴。在第三届精准医学与基因测序大会召开之际，罗氏测序全球商务负责人Luke Dannenberg来到北京，接受了测序中国的专访，向我们分享了罗氏测序在样品处理环节的整套解决方案及其应用。Luke先生曾在中东地区任职多年，具有丰富的国际商务经验。在他眼中，中国市场的发展前景和罗氏测序的未来愿景又是怎样的呢？ 接下来就让我们一一揭晓。

测序中国：Dannenberg博士，您好！感谢您接受测序中国的专访。我们采访过许多医生和研究者，对于他们来说，样品的制备是一个非常重要的问题。研究者们非常需要快速、高效、高质量的样品制备方法。您能否为我们简要介绍一下罗氏的NGS样品制备完整解决方案？

Dr. Dannenberg：感谢测序中国的邀请！我是罗氏测序解决方案Sample Prep (样本处理)产品线的全球商务负责人，这次来到中国，我也非常期待能对中国的市场和客户有一个更深入的了解。事实上，罗氏有一整套解决方案，覆盖NGS样品制备的方方面面。我们从样品收集开始谈起。针对cfDNA的收集，罗氏推出了专门的cfDNA采集管；针对组织样品的切割，我们有AVENIO Millisect自动显微切割仪，这是一个创新的自动化组织切割系统，能够捕获具有挑战性的肿瘤样本，同时集高精密度、高准确性及高一致性于一身；我们还致力于研发自动化的DNA/RNA提取方案。KAPA Library Prep——包括HyperPrep和HyperPlus产品线——是建立在罗氏的文库制备核心技术基础上的NGS建库解决方案，满足用户对于人基因组DNA定量和质检、DNA/RNA文库制备、文库扩增、文库定量的多方面需求。另一方面，罗氏的（基因组）靶向富集系列产品也是研究者的得力助手，它可以帮助用户富集感兴趣的基因组区域，借助NGS的手段探知其中存在的SNV、InDel、CNV或结构变异。总而言之，我们希望满足用户的多样化需求，帮助他们更好地利用NGS进行科学研究。

测序中国：您刚才提到了KAPA文库制备方案。我们知道，在科研中经常遇到样品量不足这样的问题——比如cfDNA或者ChIP富集的DNA，常常难以满足建库的要求；有时，样品的质量也会成为障碍，比如FFPE样品。那么KAPA文库制备方案针对这些样品有哪些优势？如何能帮助科研人员更好地开展研究？

Dr. Dannenberg：FFPE样品对于临床研究来说，是一种极为重要的样品类型，是许多研究者绕不开的话题。KAPA文库制备方案借助于强大的KAPA HiFi高保真酶，可以实现更高的文库转化效率，确保更高的文库复杂度，降低偏好性和重复比例。KAPA文库制备的性能已经在多种极具挑战的样品类别——诸如FFPE样品、ChIP富集样品或cfDNA中得到验证。与此同时，它也应用在PCR-free的全基因组重测序或甲基化测序之中。

在应用层面，科研人员可以放心地使用KAPA文库制备方案，它的性能和稳定性已经被罗氏在世界各地的合作伙伴所广泛验证，确保得到尽可能理想的结果。

测序中国：SeqCap是一种非常强大的靶向富集技术。是什么让它如此高效？请您分享一些SeqCap在临床研究中的实际应用案例。

Dr. Dannenberg：罗氏的SeqCap靶向富集技术可以帮助用户将目光聚焦在基因组中特定的区域，去寻找导致疾病发生的变异或其他罕见变异。在目标区域上多达210万的高丰度探针可以有效地覆盖基因组上那些利用传统方法难以富集的区域，使得研究者们不必再花费额外的时间和精力在这些 “硬骨头” 上。SeqCap也被广泛应用在全外显子靶向测序之中，这一技术可以更好地平衡基因组高覆盖度区域和低覆盖度区域之间探针的分布，从而得到更均一的基因组覆盖度，当然前提是你要有足够多的探针。这也就是SeqCap技术的优势所在。

应用SeqCap技术的小panel——它们的捕获区域大小通常在100万~700万个碱基之间——可以被用于研究遗传性疾病，如心血管疾病、神经系统疾病或遗传性肿瘤；而大一点的panel或是外显子捕获panel则更多地被应用于寻找与疾病发生发展相关的遗传变异。

测序中国：MSK-IMPACT是一种全面而高效的肿瘤测序新技术，也是一个完整的、包含有临床信息收集的肿瘤样本测序的工作流程，日前相关的研究成果有MSKCC（Memorial Sloan Kettering Cancer Centre）相应的研究小组 发表在Nature Medicine上。该技术的重要组成部分就是KAPA文库制备和NimbleGen SeqCap技术。那么您能否分享更多的，将罗氏测序技术应用到临床研究和应用的实际案例呢？

Dr. Dannenberg：好的，我有两个故事想和大家分享。第一个故事涉及到全外显子测序技术。2010年，在罗氏和威斯康星医学院的合作过程中遇到了一个案例：一个名叫尼古拉斯·沃克的小男孩患有严重的肠道炎症，做了上百场的大小手术，甚至切除了结肠。随着病情的发展，医生也变得束手无策。作为最后的尝试，他们将男孩送去做了基因测序，希望通过罗氏的SeqCap全外显子富集产品结合测序找出致病变异。在某种程度上说，这是最后的一棵救命稻草。幸运的是，我们成功了。致病变异的发现帮助医生确定了最为合适的个体化治疗方案：脐带血骨髓移植。这是一个早期的将基因测序应用到临床上的案例，让人欣慰的是，随着技术的发展和普及，目前已经有成千上万这样的案例，告诉我们如何借助测序的力量辅助疾病的诊断和治疗。

另一个较为新近的例子与病毒学有关。罗氏的SeqCap Shared Designs网页向用户分享多种预先设计的NGS panel，其中一个叫做VirCapSeq-VERT，用于对共计207种已知的可以感染脊椎动物的病毒的序列进行捕获。与传统方法相比，VERT极大地提升了病毒序列鉴定的敏感性，帮助用户在复杂的样品背景中准确鉴定病毒的序列。发表与mBio的一篇文献指出，对于新的病毒序列——哪怕它与已知的病毒序列有40%左右的差异，也可以通过VERT检出。对于那些想要研究病毒组的构成和动态变化的研究来说，VERT是一个极其有力的工具。

测序中国：“先患者之需而行”（Doing Now What Patients Need Next）是罗氏的口号。请您向我们介绍一下罗氏的企业价值和在测序领域的未来愿景。

Dr. Dannenberg： “先患者之需而行” 是罗氏的核心愿景和使命所在，是罗氏发展前行的立身之本。为了做到这一点，罗氏测序部门始终致力于研发、组合及优化高通量测序各项核心技术，从而将测序技术从实验室走向临床，让医生能够基于患者的基因和变异信息，为他们提供更加个体化的治疗方案。

个体化医疗需要“首尾衔接”，就测序而言，我们需要一个易用的、流程化的、“从样品直达结果”的整体化解决方案。在之前的谈话中我着重介绍了样品制备的各个环节及罗氏产品的技术特点，对于测序本身，以及之后的数据解读环节和临床应用环节，罗氏也在持续性地进行技术研发和创新，整合所有这些技术和产品，希望为人们的健康和疾病的诊疗贡献自己的力量。

测序中国：您曾在中东工作过4年时间，积累了丰富的国际商务经验。请谈谈您对中国市场的看法。

Dr. Dannenberg：我在罗氏工作了10年时间，其中四年都是在中东地区的罗氏销售部门工作。和中国一样，中东地区也是一个快速增长的市场。但是最让我印象深刻的还是这几周来在中国的所见所闻，我看到了许许多多心怀梦想、充满激情的人们，热情洋溢地投入到NGS领域的技术研发和应用推广之中。我上一次到中国是在2010年，回想起那时我所观察到的情况，不由得感慨这七年间中国的NGS事业所取得的巨大进步。不管是企业、医院还是科研院所，都在努力推动NGS的应用场景，我也非常高兴地看到，有越来越多的客户借助罗氏的KAPA、SeqCap技术推进自己的研究工作，我期待着在中国找到更多的合作伙伴，共享NGS快速发展给我们带来的无限可能。