美国加州大学圣地亚哥分校医学院和穆尔斯癌症中心的研究人员开发了一种用于分析基因拷贝数变化的新工具，基因拷贝数改变是肿瘤遗传学中容易被忽视的一个方面。这种变化叫做体细胞基因拷贝数改变（somatic copy-number alterations），该研究认为这种改变可能是疾病进展的关键，或可为卵巢癌及其他恶性肿瘤的治疗提供新的治疗思路。

“大多数人接触到肿瘤遗传学都会想到促进肿瘤形成的单个关键突变——比如BRCA基因。这些突变经常被当做肿瘤的驱动因素，但是单个点突变并不是影响肿瘤生长的唯一因素。我们对其他可能性进行了探究。”文章作者Joe R. Delaney这样说道。

癌细胞中超过90%的遗传变化都是缺失或获得一个基因的拷贝而非突变。一个肿瘤细胞可能有一个拷贝或三个拷贝而非正常的两个拷贝。

该研究领域还没有得到非常深入的研究，关于其他疾病的研究经历让科学家们了解到缺失一个基因拷贝可能不会导致疾病症状，因为另外一个拷贝可以起到一定的弥补作用。

研究人员怀疑如果协同执行相同细胞功能的几个基因都缺失单个拷贝是否会导致疾病症状的出现以及在不同癌症中存在什么样的缺失模式。他们设计了一种叫做HAPTRIG的计算工具来发现因基因拷贝缺失或增加而被显著破坏的信号途径。

卵巢癌细胞中存在许多基因拷贝变化，超过60%的基因都受到影响。研究人员利用HAPTRIG技术进行了分析，结果发现细胞自噬途径受到了显著影响。卵巢癌细胞虽然一直在利用细胞自噬，但是也会缺失一些自噬相关基因的拷贝导致自噬能力受到影响。

随后研究人员利用已经得到美国FDA批准的一些药物进行组合来靶向自噬，在几种不同的小鼠癌症模型中发现卵巢癌细胞对这些药物高度敏感——即使癌细胞已经对标准化疗药物产生了抵抗。这些药物组合的毒性弱与标准化疗药物，并且相对便宜，研究人员认为应当对这些药物进行临床评估。

研究人员表示，在进一步的工作中，该研究的发现将会促进新治疗方法的开发用于治疗对化疗产生抵抗的卵巢癌，也会增强对其他癌症的治疗。

参考文献：Joe Ryan Delaney et al. Haploinsufficiency networks identify targetable patterns of allelic deficiency in low mutation ovarian cancer. DOI: 10.1038/ncomms14423

来源：生物谷