近日，发表在Molecular Cell杂志上题为“Cas13b Is a Type VI-B CRISPR-Associated RNA-Guided RNase Differentially Regulated by Accessory Proteins Csx27 and Csx28”的研究中，张锋带领的研究小组发现了两个新型的RNA靶向CRISPR系统。这类新系统利用了一种新的Cas酶——Cas13b。

研究发现，Cas13b具有靶向和编辑RNA的能力。仅靶向RNA的这一能力使得研究人员能够以高通量地方式特异性地操纵RNA，从而用于研究广泛的生物过程。

Broad研究所的报道称，为寻找CRISPR系统，张锋实验室采用计算机数据挖掘方法搜寻了不同微生物的基因组。不同于先前的生物信息学方法，张锋和他的研究小组致力于寻找缺乏cas1基因（与CRISPR免疫力相关的最常见的基因）的系统，以期找到新的CRISPR系统。

这一新发现的酶与张锋研究组去年6月在Science杂志上（论文：C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector）提出的Cas13a（先前被称为C2c2，一种RNA靶向酶）有一些共同的特性。

像Cas13a一样，Cas13b仅需要单个向导RNA就能找到靶标，并且从遗传学的角度是可编码的。此外，Cas13b能够同时靶向多个RNA转录本。但Cas13b也有一些独特的特点，表明它与Cas13a是不同的。这些特性使得Cas13b更适用于微调基因功能。

该研究的共同第一作者Neena Pyzocha说：“Cas13b是一个最新的基因编辑工具。我们期望它能够在未来支持一些研究进展的产生。”

Cell重要文章：一图详解2类CRISPR系统

事实上，此次发现的CRISPR-Cas13b属于2类VI-B型CRISPR系统。今年1月，张锋在Cell杂志上发表了一篇题为“SnapShot: Class 2 CRISPR-Cas Systems”的SnapShot，对2类CRISPR系统进行了详细的归纳（见文末图）。

文章称，CRISPR-Cas系统是在原核生物中发现的适应性免疫系统，基于不同的效应蛋白被分为两类。1类CRISPR-Cas系统利用多个蛋白效应器复合物（multi-protein effector complexes），而2类CRISPR-Cas系统利用单个蛋白效应器。基于不同的效应蛋白家族，2类CRISPR-Cas系统被分为3种类型，9个亚型。第10个亚型还有待证明。

文章具体介绍了不同亚型的2类CRISPR-Cas系统的作用机制、起源与进化，以及应用方向。作者们认为，从概念上说，主要包括三个方面的应用：1）基因编辑，包括基因敲除、基因敲入以及引发突变；2）基因调控以及递送各种功能的部件（如转录因子）到DNA中独特的位置；3）利用Cas13（VI effector）靶向ssRNA。

参考资料：

Researchers harness novel RNA-targeting CRISPR system

SnapShot: Class 2 CRISPR-Cas Systems

来源：生物探索