NCI-MATCH在最近一期的Journal of Molecular Diagnostics公布了一项经过了FDA审查的NGS试验流程。开发人员使用这项试验流程保证了来自于数以百计收集点的组织样本最终在四个不同测序实验室的分析结果具有可重复性。
这项流程将为基础的临床试验和验证提供NGS模板，保证了标准实验室之间的可重复性，加强临床实验室间的合作，特别是在共享基准样品的基准性能指标。
亮点 1. 规范化的采集流程
NCI规定了一个共同的样品采集套件，含所需要的必要物件，以及可控的温度，使得所有样品被视为相同的。在样本评估和规范样本采集过程中，还制定了一些标准，比如哪些类型的病变适合用于组织活检。
亮点 2. 规范化的核酸提取流程
对于核酸提取流程，所有样本首先必须送到MD Anderson癌症中心，在此提取核酸，再将RNA转化为cDNA。然后将测序样本传递给四个测序实验室（弗雷德里克癌症研究国家实验室，麻省总医院，德克萨斯大学MD安德森癌症中心和耶鲁医学院）进行测序。
亮点 3. 统一的测序分析流程
为确保所有四个实验室以相同的SOP进行试验，四个实验室的相关人员都在弗雷德里克癌症研究国家实验室进行了为期一周的培训。在数据分析中，所有的试验数据使用统一的数据分析方式（参数一致），因为不同的数据参数设置会导致不同的结果。
自2016年5月中期试验成功公布截至2017年2月底，NCI-MATCH发布最新试验进展：
1. 由于中期试验测序样本与治疗组的匹配率为9%低于预期的10%，所以后续治疗组数量由10组增加到了24组，预期有23%的人可以和24个治疗组匹配，以覆盖更多的人群；
2. 中期计划中将实验人4数从3000拓展到5000，现已超过预期达到6000人，每天最多已经可以对100人进行测序，计划在5月可将6000人测序完成；
3. 截至2月中旬，对于4500个样本中的4000个合格样本进行了测序，其中约700人，大约 18%的人和24治疗组进行匹配，低于预期的23%；
4. 在匹配的人中有72%接受了推荐的治疗，高于预期的50-60%；
5. 治疗组人群分布不均：有2个治疗组没有匹配的病人，有6个治疗组少于10个人，只有11个治疗组人数过半。
1. 独立可重复：试验标准的出台，希望不同实验室、不同实验平台使用同样的样本都可以达到相同的可重复的结果，而不是全部收敛到同样的测序平台上；
2. 复制和改进：跨实验室的合作模式将进一步复制，对SOP持续也将改进，以应对可能新增加的治疗组；
3. 多种选择：每个技术平台都有优缺点，要根据样本类型和覆盖的目标而确定使用什么平台。
NCI-MATCH始于2015年8月，全称为“美国国家癌症研究所-分子分析治疗选择试验”，该试验由ECOG-ACRIN癌症研究小组和NCI共同开发，属于第二阶段的精准医疗临床试验。其目的是为了探索，如果在不考虑患者所患肿瘤类型的情况下（癌症发生的位置和病理分型），针对特定基因突变的肿瘤患者使用特定药物，最终能否得到有效的治疗。即依靠突变而非癌症发生位置来治疗癌症是否可行。
NCI-MATCH研究早期
研究早期阶段，科学家们计划从至少3000名患者中筛选出1000人入组，其中四分之一的患者需患有罕见肿瘤（非小细胞肺癌、前列腺癌、乳腺癌和结肠癌之外的癌症）。试验拟将各类型肿瘤患者与20多个治疗组（以特定基因突变为靶点的药物或药物组合，初期试验使用10组）进行匹配治疗，观察治疗效果。
NCI-MATCH中期成果回顾
至2016年3月9日，NCI-MATCH已经对645名患者进行了基因检测，并取得了阶段性的进展和成果。2016年5月份NCI-MATCH中期试验进展公布：
1. 收集了795个样本中，对最终符合标准的645个样本进行了研究，样本合格率达到了80%以上；
2. 9%的受检患者的位点突变可以匹配治疗组的治疗方案，只比原本预期低1%；
3. 大多数的突变发生率比癌症基因组图谱和其他来源的预计值要低的多。
NCI-MATCH中期试验结论
1. 基于肿瘤遗传特性的治疗试验在美国国家癌症研究所及其资助的组织中是可行的；
2. 通过测序识别肿瘤的生物学特性是可行的，已经有87%的患者完成了这个过程；
3. 在早期分析中，高比例的罕见恶性肿瘤可为后续的治疗进展提供更多的选择；
4. 允许增加早期的试验数据，以丰富研究的内容；
5. 允许在早期试验中，对特定异常基因进行分析以满足患者对更多治疗药物的实际需求。
参考文献：
NCI-MATCH Assay Validation Provides Template for Others; Trial on Track to Screen 6K by May
Analytical Validation of the Next-Generation Sequencing Assay for a Nationwide Signal-Finding Clinical Trial: Molecular Analysis for Therapy Choice Clinical Trial. J Mol Diagn. 2017 Mar;19(2):313-327. doi: 10.1016/j.jmoldx.2016.10.007. Epub 2017 Feb 7.
来源：元码基因/Benjamin
本文由来源 元码基因，由 王迪 整理编辑！
