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此前研究发现一些艾滋病疫苗在猴子模型上能取得一定程度的成功，猴子模型通常会使用SIV——会在恒河猴中引起艾滋病的艾滋病病毒（HIV）的一种近亲。但有一种疫苗长期以来都显得与众不同。它是由俄勒冈健康和科学大学疫苗和基因治疗研究所的Louis Picker和同事设计的，该疫苗把SIV基因植入无害的“特洛伊木马”病毒中。Picker团队给200多只猴子注射了该疫苗，然后通过注射一种严重的SIV病毒“挑战”它们。加起来，有55%的动物暂时被感染，接下来它们会完全控制病毒数年，甚至清除病毒。然而，仍有两个顽固的问题：Picker和同事需要确定疫苗为什么会成功使机体产生免疫应答；同时解释为什么疫苗会经常失败。

西雅图华盛顿大学免疫学家Michael Gale Jr.描述了其团队如何通过宏观观察受保护和未受保护动物的活性基因来探索这些问题。研究人员分析并比较了两组动物升高或降低的基因簇。这些基因控制着各种白介素（在免疫细胞之间传递信息的生化物质）、细胞生长和炎症的产生。他们在第3天深入探究了两个群组中具有不同表达水平的234个基因，发现仅仅通过观察这些基因，就能以91%的准确性预测疫苗注射能否保护动物。

意大利米兰大学免疫学家Mario Picker表示，这些发现为调整其疫苗提供了新的方法。“很明显，疫苗在给某个东西‘挠痒’，关键的问题是通过某个通道让这种作用变得更强。”他举例说，这些基因共同控制着白介素-10的产生，在受到保护的动物中，它们会变得更高。“如果确实是一个至关重要的信号，我门可以操纵它”。Picker在加利福尼亚旧金山联合创办了韦维尔生物技术公司，该公司计划明年开始在人体上测试该疫苗。

在治疗方面，波士顿哈佛医学院贝斯以色列女执事医疗中心病毒学和疫苗研究中心主任、免疫学家Dan Barouch几乎采用了所有方法对付该病毒。他的团队首先用SIV和HIV病毒的混合体SHIV感染了44只猴子。1周后，科学家开始用抗逆转录病毒药物（ARVs）治疗所有动物，并持续了两年。在所有44只猴子中，该病毒在标准血液检测中均降低到无法检测的水平。然后，研究人员将这些动物分成4组，或是不给其注射任何药物（对照组），或是注射一种有效的HIV抗体，或是给其一种与Toll样受体7（TLR7）结合的药物——可抑制先天免疫系统细胞，或是给其抗体加上TLR7药物。16周后，他们停止了所有的抗逆转录病毒治疗。

在使用抗逆转录病毒药物控制HIV达到无法让研究人员在血液或组织中发现该病毒的前提下，HIV通常会在停用药物几周后卷土重来。这正是11只控制组动物发生的情况。在接受TLR7药物或该抗体的22只猴子中，有20只不能继续抑制SHIV。而在接受了抗体加TLR药物的小组中，11只猴子中有5只在半年后仍未看到SHIV卷土重来（实验仍在进行中），而其他的猴子则存在低水平的HIV。“这个概念性研究的初步证据让我们备受鼓舞。”Barouch说。

治疗HIV感染的一个关键障碍是，即使人们的病毒水平无法检测到，却仍然存在含有标注着“潜伏”病毒DNA染色体的细胞库，它不会产生子代，因此就躲过了免疫系统的雷达探测，但它会突然运行并引起混乱。早期的猴子研究表明，TLR7药物可让新近感染的细胞“休克”，阻止其产生病毒，并将其设置为消除。许多团队都曾在猴子和人体上尝试过“休克—杀灭”实验。“这是证明‘休克—杀灭’方法有作用的首个证据。”Picker说。

Picker和其他人则提出了几个重要的警告。很有可能HIV会重新返回这5只猴子体内，因为此前被认为治愈的人类患者在停止服用抗逆转录病毒两年多后重新感染了HIV。而在该实验中，抗逆转录病毒治疗是在感染后1周开始的，这么快的治疗情况很少会在人类患者中出现。与Picker实验中使用的SIV相比，SHIV也更容易让猴子自然地控制。考虑到这些，马里兰州弗雷德里克美国国家癌症研究所进行SIV研究的Jeffrey Lifson说，这些发现是“有趣的、令人兴奋的，而且具有潜在的重要性”。

加州大学旧金山分校临床医生Steven Deeks说，他计划在患者中测试一种类似的TLR药物和一种强效抗体的组合，这些患者体内的HIV已被完全抑制多年。“这里没有明确的机制，作为一名临床医生，我不在乎这些。”他说，“它就像一个大黑匣子：你把一些东西放进去，就会出来一些结果。这里的结果是没有病毒。”