表观星云(Epigenetics Cloud,EC)平台
2018年5月28日,中科普瑞继十万人甲基化组计划(表观星图计划)发布后,再度发力科研临床应用领域,联合云平台服务企业—海云基因共同发布表观星云(Epigenetics Cloud,EC)平台,为表观组学临床和科研应用助力。测序中国对本次发布会进行了报道。
为推动十万人甲基化组计划,秉承着“助力表观星图,兴健康”的理念,中科普瑞和海云基因达成了战略合作。中科普瑞CTO戴珩博士、中科普瑞研发副总黄炳顶博士、中科普瑞技术产品总监(十万人甲基化组计划首席科学家)李明辉博士、中科普瑞科研服务运营总监黄彦女士、海云基因CEO潘峰先生、海云基因CTO曹春笋先生等出席了此次签约仪式和发布会。
中科普瑞表观星云平台(Epigenetics Cloud)签约发布仪式
表观星图计划首席科学家李明辉博士与海云基因CTO曹春笋签约
发布会上,表观星图计划首席科学家李明辉博士介绍到,“表观星云(Epigenetics Cloud)是中科普瑞打造表观基因组研究综合解决方案的重要举措,这一平台将为表观遗传学研究提供便利的在线研究工具。首先,从功能层面上来说,表观星云除了传统云服务提供的智能检索、可视化操作、自动化pipeline、全自动报告生成等功能外,它还提供丰富的甲基化解决方案,使科研选择不再单一,让科研人员的研究走向个性化、可定制;其次,从数据库更新来说,科研要紧跟时代潮流、抓取前沿研究,让科研与时俱进,和国际接轨。而甲基化研究是一个长期且需要不断维护的过程,因此,就需要数据库保持更新,杜绝死库、旧库;最后,从知识库建立来说,现在国内没有一个完备的甲基化知识库,中科普瑞基于当前NLP的进展结合当下的人工智能算法进行文本筛选和分词处理结合人工阅读,打造国内最具权威的甲基化知识库。
基于以上几点,中科普瑞推出了表观星云平台,期待它能让科研走的更远,也希望中科普瑞能够持续创造价值,为国内科研贡献绵薄之力。”
表观星云平台(Epigenetics Cloud)界面
随着数字媒体化进程的推进,越来越多的企业转向云计算(Cloud Computing)服务。据悉,中科普瑞此次发布表观星云平台,将通过打通上下游产业链,为精准医疗打造全方位服务平台,公司的中长期发展策略为医学大数据挖掘和人工智能的临床应用,该平台对于相关科研领域的研究起到加速推进的作用,也将大大助力十万人甲基化组计划的项目执行。
表1:表观星云工具包
紧跟前沿科学研究成果,掌握最新动态
紧跟前沿科研研究成果,通过对国内外研究成果解读,整合最新的分析流程、分析方法,为十万人甲基化组计划提供更加符合科研“潮流”的分析过程。在表观星云中整合最新的表观文献和数据,供您查询。
甲基化研究文献查询展示
通过十万人甲基化组计划,为国内科研提供有力的依托背景数据。整合各个公共甲基化数据库资源让数据实时更新,让表观遗传学研究更加便捷。
表观星云平台(Epigenetics Cloud)界面
在强化本地数据库的同时,采用NLP技术对文献进行深度挖掘,然后结合人工审核校对,训练出一套专家系统,让甲基化研究进程加速。
专家系统展示(左为NLP分析流程,右侧为表观星云展示结果)
表观星云平台流程公测
表观星云平台测试申请,请咨询:market@sinomics.com
十万人甲基化组介绍
表观星图计划(Epigenetics Atlas Project)是国内首个大型甲基化组项目,通过与国内外基因组队列计划联动以及与Illumina公司的战略合作,建立中国人甲基化基准数据库,为表观遗传领域研究、应用和临床检测等建立基础数据库。该项目计划首期完成十万人甲基化芯片与大数据分析,后期逐步扩大范围,通过甲基化基准基因数据库的建立,为科研和临床研究,乃至临床检测等应用提供基础数据库,并建立相关标准,为国内各科研单位和医疗机构的精准诊断和精准治疗提供甲基化层面的基因数据保证,同时为全球华人的精准诊断提供更为精准的参考。
中科普瑞
中科普瑞基因科技公司是由基因科技领域老兵组成的新军,企业创始人与核心骨干团队均从事该行业15年以上,目前着力布局基因检测的临床应用开发与科研技术服务平台。中科普瑞下设全资子公司上海鲸舟基因科技有限公司/上海鲸舟医学检验所,立足新一代测序及其衍生技术,以医学生物信息学为核心,提供覆盖肿瘤分子病理诊断,用药指导和预后预测,早期筛查、甲基化研究和应用、新型病原微生物感染、重大疾病风险评估、多组学科技服务等符合临床需求的解决方案。公司在上海建立了符合美国CLIA和CAP认证标准的医学检验实验室,在深圳建立了工业化的消费级基因检测实验平台。
中科普瑞基因科技是十万人基因组计划协同项目-十万人甲基化组计划(表观星图计划)的项目实施方,公司科研服务平台致力于提供以表观基因组学研究为特色的多组学研究系统整体解决方案,具有丰富的项目课题经验,并通过十万人甲基化组项目建立中国人DNA甲基化基准数据库。
海云基因
海云基因以海内外高等院校的专家教授团队为依托,拥有基因组学、生物信息学、临床医学及云计算大数据应用的专业技术人员支持。公司通过开发高通量基因测序和生物信息学领域最先进的基因云计算平台GeneApps,打造服务于精准医疗数字化整体解决方案的生态系统。公司致力于医疗信息化、基因云计算平台和疾病知识库的构建互补融合,建立适合临床诊断的智能协作云流程体系,通过健康大数据来驱动精准诊疗与健康指导。
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