BD单细胞蛋白组及转录组测序流程

随着基因组学技术的发展，人们对机体的认知已经深入到单细胞水平。单细胞测序与分析技术为科学家搭建了研究单细胞蛋白质组与转录组的桥梁，在免疫、癌症、干细胞等诸多研究领域都有着重要应用。日前，世界领先的医疗技术公司BD（Becton, Dickinson and Company）正式对BD® AbSeq assay进行了商业发布。

BD公司告诉测序中国，BD® AbSeq assay可通过高通量测序来分析单细胞水平的蛋白表达，将BD Pharmingen™产品系列中的高质量抗体和寡核苷酸结合在一起，使研究人员能够在BD Rhapsody™单细胞分析平台上开展单细胞蛋白分析，同时分析数千个单个细胞中的RNA和蛋白质，完整揭示出基因和蛋白在生物学系统中的作用。

BD® AbSeq assay工作流程

据悉，目前已正式推出的BD® AbSeq assay包括：寡核苷酸-鼠抗人CD3 、寡核苷酸-鼠抗人CD4、寡核苷酸-鼠抗人CD19、寡核苷酸-鼠抗人CD25等100种核苷酸-抗体复合物。

BD公司介绍，该产品具有多项突出优势：

在过去的一年中，BD在其BD Rhapsody单细胞分析系统的基础上，建立了一套包括试剂、仪器、软件和靶向基因检测试剂盒的完整解决方案。2018年上半年推出的新产品，包括BD Rhapsody™ Express 系统和BD™ 单细胞多重分析试剂盒（多样本检测），可提供靶向RNA-seq并实现多样本检测，在提高数据质量的同时有效缩短了实验时间。而BD® AbSeq assay 是BD单细胞多组学产品系列最新推出的创新产品，研究者可在同一次实验中同时获得单细胞RNA-Seq数据以及多重蛋白表达数据，显著增进对个体细胞和细胞群的理解。

BD方面表示，使用BD Pharmigen™抗体获得的蛋白质表达数据能更好地表征样本特征（例如更清楚的细胞簇识别），结合mRNA表达数据，就可以进一步清晰地分析表征细胞特性，阐明从mRNA转录到蛋白质调控表达过程中的生物学机制（举例如下图所示）。

BD® AbSeq通过添加细胞类型特异性信息改善了细胞类型的聚类，从而更清楚地确定细胞特异性属性。4816个人PBMC细胞的tSNE计算：（A）通过来自399个基因的mRNA表达数据进行细胞聚类分析；（B）通过来自399个基因的mRNA表达及来自30个细胞表面标记的蛋白表达数据进行细胞聚类分析。

本次发布的BD® AbSeq assay系列产品涵盖100种不同的人类抗体-寡核苷酸组合。BD告诉测序中国，这只是该系列产品研发的第一阶段，后续，BD将利用其巨大的经流式细胞方法验证的人类及小鼠克隆抗体库迅速扩大该产品线。预计到2019年2月份，该产品线将涵盖500种不同的人类及小鼠抗体-寡核苷酸组合，使研究者通过一次实验同时获得单细胞RNA-Seq数据和上百种蛋白表达数据（研究者所感兴趣的目标蛋白）成为可能。此外，客户也可以自行设计并向BD定制所需要的抗体-寡核苷酸偶联物。

BD生物科学全球总裁John Ledek

对于本次创新产品的发布，BD生物科学全球总裁John Ledek表示：“BD致力于单细胞研究，所研发的工具易于使用，市场门槛低。BD Rhapsody系统和BD® AbSeq assay 这样的单细胞分析工具，能够大幅提高客户检测其感兴趣的稀有或未知细胞能力，促使免疫学快速发展，包括药物治疗反应、细胞治疗等。”

有关新产品BD® AbSeq assay的更多信息详见bd.com/genomics。

注：本文所述产品仅用于科研研究，不可用于临床诊断或治疗。