随着新一代测序技术的发展，生物信息在生物学研究中发挥了越来越重要的作用，成为生物学研究中不可或缺的工具，在科学研究，农业育种，临床医学中发挥了越来越重要的作用。随着测序行业的快速发展，数据累积越来越快，掌握生物信息技能将在生物学研究中发挥巨大的优势。
日前，青岛同源基因科技有限责任公司将于南京举办为期5天的培训课程，通过系统学习，帮助从业者深入理解测序原理及其在科研中的应用，熟练掌握Linux操作以及常用生物软件的使用，并能独立完成基因组分析、重测序分析、RNA-seq分析以及常见科学文献绘图等。培训之后，通过继续使用服务器，巩固生物信息分析技能。
2. 课程包含Linux、基因组分析、重测序分析、RNAseq分析、R语言等生物信息常用技能；
3. 以完整项目为案例，通过亲自上手操作，快速掌握技能；
4. 赠送9套500多集生物信息视频教程，可继续巩固学习；
5. 半年生物云服务器（32线程，256G，24T）使用权限，可分析自己数据；
6. 课程内容讲义一份；
7. QQ交流群，可进行后续答疑；
王通：曾任职于华大基因，8年以上生物信息分析经验，擅长基因组，转录组，宏基因组，肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业，致力于生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者，已制作视频500集以上。首创视频＋云服务器培训模式，目前已在北京、深圳、哈尔滨、杭州、武汉、长春、青岛等组织过多场培训班，线上线下累计学员超过4000多名。
时间：11月28~12月2日（五天） 8:30~17:00
上课地址：中国 · 南京
培训费用：5000元
付款方式：银行对公转账
户 名：青岛同源基因科技有限责任公司
开户银行：中国建设银行青岛高新区支行
账户：37101006101052502221
备注：
1. 有关现场刷卡或扫码支付、会议通知等请联系工作人员。
2. 联系方式：13424439895
| 第一周 | ||
| 日期 | 主题 | 课程安排 |
| 第一天
上午 |
基因组Denovo分析 | 生物信息学简介
实践一：登录服务器 SSH登录服务器 服务器上传下载数据 Linux基本命令 实践二：数据质控 测序原理 fastq文件格式介绍 数据质控fastqc 实践三：编写脚本 vim文件编辑 进程管理 管道 重定向 |
| 第一天
下午 |
基因组Denovo分析 | 实践四：数据过滤
利用fastp软件过滤数据 实践五：序列处理 文本筛选grep 高级命令sed 高级命令awk seqtk工具 实践六：序列拼接 kmer估计基因组大小 pairend reads连接 基因组序列拼接 三代测序拼接 拼接结果评估 GC-depth图 如何改善拼接结果
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| 第二天
上午 |
测序原理及数据质控 | 实践七：基因组分析
基因预测 ncRNA分析 重复序列分析 基因功能注释和功能分类 其他基因组分析 在线分析 实践八：构建系统发育树 批量下载序列 多序列比对 利用mega构建系统发育树 iTOl美化系统发育树
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| 第二天
下午 |
常见基因组分析 | 实践九：基因组比较
全局比对 局部比对 寻找共有基因 实践十：其他 生物软件下载 编译安装软件 bioconda安装软件 参考基因组下载 生物数据库下载 Aspera高速下载
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| 日期 | 主题 | 课程安排 |
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第一天
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重测序分析 | 重测序简介
变异检测基本原理 GWAS、WGS、WES、RAD、GBS、BSA 实践十一：短序列比对 bwa比对 sam格式介绍 samtools处理sam格式文件 实践十二：SNP检测 利用freebayes找SNP vcf格式介绍
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| 第一天
下午 |
基因组变异检测 | bcftools处理vcf文件
过滤SNP结果 实践十三：人全基因组分析 利用gatk找SNP 利用mutects找somaic突变 利用lumpy找SV 利用delly找SV 利用cnvnator找 实践十四：变异结果可视化 利用igv查看变异结果 实践十五：变异结果注释 变异结果注释snpeff
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| 第二天
上午 |
R语言基础 | R语言简介
R语言安装 Rstuido介绍 基本命令 安装R包 获取帮助 读写文件 R数据类型 案例1：绘制人染色体长度分布图 案例2：绘制基因表达热图 案例3：利用R实现vlookup提取数据
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| 第二天
下午 |
R语言统计分析 | 案例4：频数统计与独立性检验
案例5:t检验与wilcox检验 案例6:相关性检验 案例7:线性回归 案例8:基因组大小与基因个数线性回归 案例9：购物篮分析 案例10: R语言与机器学习案例——乳腺癌预测
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| 第三天
上午 |
R语言与生物信息 | Bioconductor简介
RNAseq原理 hisat2比对 统计reads数 利用11语言分析RNAseq数据 案例12：差异表达基因火山图 案例13：GO功能注释条形图 案例14：KEGG富集点图 |
| 第三天
下午 |
R语言绘图 | 案例15：分组条形图
案例16：基因长度分布直方图 案例17：饼图及扇形图 案例18：箱线图 案例19：韦恩图 案例20：gwas分析曼哈顿图 案例21：COG功能注释图 |
*具体课程会根据现场情况适当调整
本文由 SEQ.CN 作者：白云 发表，转载请注明来源！
