NBT | 生物信息平台DRAGEN可30分钟完成大规模全基因组分析和多种变异检测 陈初夏 科研 2024-11-14 该研究介绍了DRAGEN基本架构及其在SNV和Indel调用中的优异性能,以及它检测整个变异图谱的能力。
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Nat.Commun. | 赵屹/杨胜勇团队发表基于深度生成模型(PRnet)进行新化合物扰动转录响应预测加速药物研发 白云 科研 2024-11-13 该模型首次实现了新化合物、新细胞类型、任意剂量的扰动转录响应预测。
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JAMA Netw Open|多中心队列研究揭示,RNA+DNA-NGS联合检测可提高晚期NSCLC患者SV检出率 白云 科研 2024-11-11 RNA-NGS具有强大的临床敏感性,当与DNA-NGS结合用于现有和新兴可操作结构变异时,可显著增强检测
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NEJM | 研究首次证实lncRNA CHASERR基因单拷贝缺失可导致新型神经发育障碍 白云 科研 2024-11-11 该研究首次提供了CHASERR单拷贝缺失导致神经发育疾病的科学依据,发现了CHD2具有双向剂量敏感性,并强调了lncRNA在神经发育中的重要性。
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胡璐璐/刘杰/何川等团队合作开发定量检测超微量样本中核酸表观修饰的新方法LAMP-MS 白云 科研 2024-11-11 LAMP-MS(及m6A核酸质谱方法)可以实现超低量样本的甲基化检测,且结果可以直接可视化,不需要高通量测序繁复的数据分析处理过程,因此有潜力作为表观遗传学领域重要的实用工具,为科研工作者的实验室研究和临床样本检测提供了广阔的应用前…
胡璐璐/刘杰/何川等团队合作开发定量检测超微量样本中核酸表观修饰的新方法LAMP-MS 白云 科研 2024-11-11 LAMP-MS(及m6A核酸质谱方法)可以实现超低量样本的甲基化检测,且结果可以直接可视化,不需要高通量测序繁复的数据分析处理过程,因此有潜力作为表观遗传学领域重要的实用工具,为科研工作者的实验室研究和临床样本检测提供了广阔的应用前…
Nat Commun | 利用cfDNA片段组监测癌症治疗的新方法DELFI-TF,无需肿瘤先验遗传信息即可确定肿瘤负荷! 戴胜 科研 2024-11-08 DELFI-TF在监测治疗方面比传统临床方法更敏感。
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Nat Commun | 探索长寿奥秘:百岁老人罕见LOF突变负荷显著降低,揭示健康长寿的潜在遗传机制 白云 科研 2024-11-06 研究团队使用全外显子组测序数据分析了LGP和 LonGenity 队列德系犹太人个体,发现百岁老人身体中有害LOF突变负荷显着降低,并确定了具有显著水平的基因和通路。
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NBT|任兵团队开发新型高通量单细胞染色质构象分析技术Droplet Hi-C,填补异质组织染色质分析的关键空白 陈初夏 科研 2024-11-06 Droplet Hi-C可用于识别癌症细胞中的结构变异和染色质结构,从而阐明驱动肿瘤进展和耐药性的调控程序,为理解肿瘤演变和治疗反应提供了巨大的潜力。
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Nat Genet | 基于WGS数据绘制癌症进展过程中ecDNA扩增图谱,揭示抗癌新靶点 戴胜 科研 2024-11-06 研究团队通过一个计算密集且标准化的分析流程,统一处理了来自8,060个不同癌症患者的WGS数据,比较了癌症诊断时和疾病晚期的ecDNA频率和特性。
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杨运桂/张世华团队开发整合组织学图像和空间基因表达谱的深度学习方法STASCAN,破译高分辨率细胞分布 戴胜 科研 2024-11-06 STASCAN在不同组织样本中的应用已经证明了其在提高空间分辨率和发现新结构方面的卓越性能,为解决不同类型组织在不同发育、再生和疾病阶段的细胞类型分布提供了潜力。
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