NBT|任兵团队开发新型高通量单细胞染色质构象分析技术Droplet Hi-C,填补异质组织染色质分析的关键空白 陈初夏 科研 2024-11-06 Droplet Hi-C可用于识别癌症细胞中的结构变异和染色质结构,从而阐明驱动肿瘤进展和耐药性的调控程序,为理解肿瘤演变和治疗反应提供了巨大的潜力。
Nat Genet | 基于WGS数据绘制癌症进展过程中ecDNA扩增图谱,揭示抗癌新靶点 戴胜 科研 2024-11-06 研究团队通过一个计算密集且标准化的分析流程,统一处理了来自8,060个不同癌症患者的WGS数据,比较了癌症诊断时和疾病晚期的ecDNA频率和特性。
杨运桂/张世华团队开发整合组织学图像和空间基因表达谱的深度学习方法STASCAN,破译高分辨率细胞分布 戴胜 科研 2024-11-06 STASCAN在不同组织样本中的应用已经证明了其在提高空间分辨率和发现新结构方面的卓越性能,为解决不同类型组织在不同发育、再生和疾病阶段的细胞类型分布提供了潜力。
Cell | 中山大学联合阿里云团队利用AI揭秘隐藏的RNA病毒“圈” 白云 科研 2024-11-01 该研究为大规模RNA病毒发现建立了一个AI框架,一旦准备好训练数据集,就可以很容易地扩展到对任何生物“暗物质”的准确描述。
Nat Commun | 浙江大学良渚实验室沈宁/刘志红课题组开发多模态深度学习模型,可预测疾病相关的组织特异性可变剪接 戴胜 科研 2024-10-30 RNA可变剪接(Alternative splicing)是基因转录后一种重要的调控机制,也是生物体多样性和蛋白质多功能性的重要来源之一。人类约90%以上的基因存在可变剪接,不同组织与细胞类型中可变剪接的多元性促进了细胞表型的多样性…
关注新生,预见未来 | 将基因组测序纳入新生儿筛查可行且有益!GUARDIAN项目最新研究成果在JAMA发表 陈初夏 科研 2024-10-30 强调了利用基因组测序扩展现有NBS以实现更广泛遗传病筛查的可行性和有益结果。
Nat Commun | 刘鹏/王贵强/项光新团队开发多场景、超灵敏气溶胶呼吸道病毒监测系统,实现亚单拷贝空间病毒分辨率 白云 科研 2024-10-28 研究团队开发了RIAM,该系统能够对气溶胶中的 SARS-CoV-2和其他呼吸道病毒进行超灵敏和连续监测
Genome Med | 首次揭示DNA去甲基化可促进结直肠癌细胞释放cfDNA,或可提高液体活检的灵敏度 陈初夏 科研 2024-10-28 该研究首次在CRC临床前模型的大型数据集中剖析了cfDNA的释放情况,发现癌细胞DNA甲基化状态与cfDNA释放相关,DNA去甲基化可促进cfDNA释放,且与染色质可及性和碎片化增加有关。