Nat Commun | 结合HiFi、Hi-C技术优势的新算法pstools,可高效、准确重建癌症染色体单倍型基因组 白云 科研 2023-04-07 该研究将高分辨率测序技术(HiFi和Hi-C)应用于COLO829癌症系,并开发了一种快速、准确的计算方法pstools,其性能优于现有方法trio-hifiasm和salsa2,有助于精确发现SV、重建染色体水平单倍型基因组
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Leukemia | 高分辨率泛基因组分析揭示,光学基因组图谱可实现血液肿瘤患者的精准分层 白云 科研 2022-08-29 OGM不仅可以检测基因水平的改变,还可以检测外显子水平的SV,例如涉及KMT2A的部分串联重复等。
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Genome Biology | 精准解析SNV、SV和甲基化的综合性分析方法PRINCESS,填补基因组学研究空白 白云 科研 2021-10-28 研究团队针对目前测序数据分析短板(对于长度数据中染色体结构变异的综合分析)进行了补充,开发了一种可以精准解析SNV、InDel、SV和甲基化数据的单倍型分析方法:PRINCESS。PRINCESS能够以最低的成本为每个样本提供全面的…
Genome Biology | 精准解析SNV、SV和甲基化的综合性分析方法PRINCESS,填补基因组学研究空白 白云 科研 2021-10-28 研究团队针对目前测序数据分析短板(对于长度数据中染色体结构变异的综合分析)进行了补充,开发了一种可以精准解析SNV、InDel、SV和甲基化数据的单倍型分析方法:PRINCESS。PRINCESS能够以最低的成本为每个样本提供全面的…
首个基于纳米孔测序的冰岛人群基因组数据发布,揭示大量结构变异在人类疾病中的作用信息 陈初夏 科研 2019-12-05 近日,冰岛deCODE genetics公司领导的研究团队首次使用牛津纳米孔技术(ONT)测序进行了人群规模的测序研究。
首个基于纳米孔测序的冰岛人群基因组数据发布,揭示大量结构变异在人类疾病中的作用信息 陈初夏 科研 2019-12-05 近日,冰岛deCODE genetics公司领导的研究团队首次使用牛津纳米孔技术(ONT)测序进行了人群规模的测序研究。
《自然·通讯》| 多种基因测序平台联合解析人类基因组结构变异,有效提高检测效率 陈初夏 科研 2019-04-22 科学家整合了一套先进的基因技术,该方法能够在单核苷酸水平,以单倍型感知的方式对SV进行全面评估。
《自然·通讯》| 多种基因测序平台联合解析人类基因组结构变异,有效提高检测效率 陈初夏 科研 2019-04-22 科学家整合了一套先进的基因技术,该方法能够在单核苷酸水平,以单倍型感知的方式对SV进行全面评估。
Hi-C、WGS、光学图谱三位一体,癌症基因组结构变异检测实现新突破! 戴胜 科研 2018-09-14 宾夕法尼亚州立大学岳峰课题组等团队,将Hi-C技术、WGS和Bionano光学图谱技术结合,开发了一种SV综合检测方法,可用于癌症基因组SV的系统分析,能够全面了解癌症基因组变化。
Hi-C、WGS、光学图谱三位一体,癌症基因组结构变异检测实现新突破! 戴胜 科研 2018-09-14 宾夕法尼亚州立大学岳峰课题组等团队,将Hi-C技术、WGS和Bionano光学图谱技术结合,开发了一种SV综合检测方法,可用于癌症基因组SV的系统分析,能够全面了解癌症基因组变化。